ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Adoxophyes honmai mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008141	TTTAT	3	130	144	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_008141	ATA	4	522	533	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108793379
3	NC_008141	TTTA	3	880	890	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	108793379
4	NC_008141	TTTA	3	923	933	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	108793379
5	NC_008141	TAAAAT	3	1202	1219	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108793379
6	NC_008141	ATTTT	3	1397	1411	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_008141	GAAA	3	2276	2287	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	108793380
8	NC_008141	ATT	4	2892	2904	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	108793380
9	NC_008141	TAATTA	3	3181	3198	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108793381
10	NC_008141	AATT	3	3761	3771	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793381
11	NC_008141	TATTTT	4	3969	3992	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	108793382
12	NC_008141	TAA	4	4032	4042	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108793382
13	NC_008141	TAATT	3	4121	4134	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	108793383
14	NC_008141	CT	7	4384	4397	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	108793383
15	NC_008141	AATT	3	4439	4449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793383
16	NC_008141	AATT	3	4755	4765	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793383
17	NC_008141	TTA	4	4907	4917	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108793384
18	NC_008141	TTTC	3	5045	5056	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	108793384
19	NC_008141	TATTTA	3	5557	5575	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_008141	ATT	4	5624	5635	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108793385
21	NC_008141	ATT	5	5648	5662	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	108793385
22	NC_008141	AAATTT	3	6151	6168	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_008141	T	12	6298	6309	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008141	ATA	5	6312	6326	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_008141	ATATT	43	6329	6538	210	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_008141	ATT	7	6330	6350	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008141	TAAA	5	6596	6616	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	108793386
28	NC_008141	TAAA	3	6646	6657	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	108793386
29	NC_008141	ATA	4	6677	6688	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108793386
30	NC_008141	TAT	4	6953	6964	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108793386
31	NC_008141	TAAAT	3	6974	6987	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	108793386
32	NC_008141	TA	6	7150	7160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793386
33	NC_008141	A	14	7185	7198	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	108793386
34	NC_008141	ATA	5	7576	7590	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	108793386
35	NC_008141	TAAA	3	7813	7823	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	108793386
36	NC_008141	TAA	4	8014	8026	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108793386
37	NC_008141	A	12	8259	8270	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	108793386
38	NC_008141	A	20	8282	8301	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	108793386
39	NC_008141	ATC	4	8703	8714	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	108793387
40	NC_008141	AAAT	3	9310	9320	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	108793387
41	NC_008141	TAA	4	9363	9375	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108793387
42	NC_008141	A	13	9638	9650	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	108793387
43	NC_008141	TAAAA	3	9652	9665	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	108793387
44	NC_008141	AT	9	9857	9874	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108793388
45	NC_008141	AT	6	9988	9998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793388
46	NC_008141	ATT	5	10140	10154	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_008141	TAA	6	10189	10206	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108793389
48	NC_008141	ATTTT	4	10313	10332	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	108793389
49	NC_008141	TTTA	3	10358	10369	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	108793389
50	NC_008141	T	12	10409	10420	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	108793389
51	NC_008141	TAA	7	10600	10620	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	108793389
52	NC_008141	TAA	4	11290	11301	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108793390
53	NC_008141	CATT	3	11302	11313	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	108793390
54	NC_008141	TTA	4	11422	11432	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108793390
55	NC_008141	TTA	4	11762	11772	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108793390
56	NC_008141	TTAA	3	11854	11865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108793390
57	NC_008141	AAATA	3	12106	12120	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	108793391
58	NC_008141	TA	6	12138	12148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108793391
59	NC_008141	A	16	12548	12563	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	108793391
60	NC_008141	TTAATA	3	12974	12992	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_008141	TA	22	13281	13323	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_008141	TTAT	3	13337	13348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_008141	AATTTA	3	13372	13390	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_008141	TTAA	3	14089	14100	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008141	AATT	3	14243	14254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_008141	ATT	4	14303	14314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_008141	AAATT	3	14520	14534	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_008141	TATT	3	14824	14834	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_008141	AATT	3	14877	14888	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_008141	ATTTA	3	14943	14957	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_008141	T	19	15220	15238	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_008141	TAA	8	15249	15273	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_008141	TAT	5	15420	15433	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_008141	TAA	8	15442	15466	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_008141	TAA	59	15442	15615	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Adoxophyes honmai mitochondrion