ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Zygnema circumcarinatum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008117AGTAA33263391460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
2NC_008117ACTTA18327533659140 %40 %0 %20 %3 %Non-Coding
3NC_008117AGAAT1518106181807560 %20 %20 %0 %6 %108796740
4NC_008117TTCTT171818218266850 %80 %0 %20 %3 %108796740
5NC_008117CAATA320897209111560 %20 %0 %20 %6 %108796740
6NC_008117TTATA322357223711540 %60 %0 %0 %6 %108796749
7NC_008117AGTTA20324333253210040 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
8NC_008117AATAC339746397601560 %20 %0 %20 %6 %108796727
9NC_008117CTAAG342328423421540 %20 %20 %20 %6 %108796750
10NC_008117AAAGA348084480981580 %0 %20 %0 %6 %108796712
11NC_008117ATAGA1049993500425060 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
12NC_008117ATTTC553130531542520 %60 %0 %20 %4 %Non-Coding
13NC_008117ATTCT1660104601838020 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
14NC_008117AAACA363425634391580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
15NC_008117AAAAT364182641961580 %20 %0 %0 %6 %126507953
16NC_008117TAATT366041660551540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_008117TAACT374599746131540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
18NC_008117TCAAA484995850142060 %20 %0 %20 %5 %Non-Coding
19NC_008117AAATT389498895111460 %40 %0 %0 %7 %108796694
20NC_008117ATTAT1692689927688040 %60 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_008117TAAAA394613946281680 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
22NC_008117TAGGT31097921098061520 %40 %40 %0 %6 %Non-Coding
23NC_008117TATAT31206181206331640 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
24NC_008117CTTTA31298031298161420 %60 %0 %20 %7 %108796684
25NC_008117TGTGT3132835132848140 %60 %40 %0 %7 %108796769
26NC_008117ATTAT31402161402311640 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
27NC_008117TAATA81434471434904460 %40 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_008117AAAAT41521681521861980 %20 %0 %0 %10 %Non-Coding
29NC_008117TAGAA31543431543571560 %20 %20 %0 %6 %108796737
30NC_008117TATTC91616661617104520 %60 %0 %20 %8 %Non-Coding