Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Zygnema circumcarinatum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008117TAA4489649061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_008117TCT463976408120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108796740
3NC_008117TAA4884288541366.67 %33.33 %0 %0 %7 %108796740
4NC_008117TGG41381713827110 %33.33 %66.67 %0 %9 %108796740
5NC_008117CTA415041150521233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108796740
6NC_008117ATT420062200731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796740
7NC_008117ACT421172211821133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %108796740
8NC_008117TAT424048240581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108796687
9NC_008117TGT42440724419130 %66.67 %33.33 %0 %7 %108796687
10NC_008117TAT425558255681133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108796687
11NC_008117TAT426086260981333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_008117ACA426404264151266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
13NC_008117TGT42730127311110 %66.67 %33.33 %0 %9 %108796756
14NC_008117TTA428109281191133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108796756
15NC_008117ATT429936299461133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_008117CAA433297333091366.67 %0 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
17NC_008117TAT435538355481133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_008117TAT536334363471433.33 %66.67 %0 %0 %7 %108796728
19NC_008117AAT437135371451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796728
20NC_008117TAT439429394391133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_008117ATA441101411131366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_008117TAA443130431421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_008117CAT444103441131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %108796735
24NC_008117TAA546909469231566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_008117ATA446928469391266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_008117GCA447167471781233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %108796712
27NC_008117TAA448021480311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796712
28NC_008117GAA448257482681266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796712
29NC_008117TTC44978849798110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_008117TAA451945519551166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_008117AAG452739527491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %108796710
32NC_008117TAA453411534221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_008117TAA453956539661166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_008117TCT45447554486120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108796697
35NC_008117ATA555857558701466.67 %33.33 %0 %0 %7 %108796690
36NC_008117TAA461195612061266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_008117TAT462001620111133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_008117TAG464590646011233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %126507953
39NC_008117TAA465815658261266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_008117TGT46592865938110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
41NC_008117TAT477016770271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796679
42NC_008117AGA477906779171266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796680
43NC_008117ACT478468784791233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108796680
44NC_008117TAC481494815051233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108796751
45NC_008117ATA581738817511466.67 %33.33 %0 %0 %7 %108796751
46NC_008117AAT484904849141166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_008117ATT485943859531133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_008117GTT48979089802130 %66.67 %33.33 %0 %7 %108796692
49NC_008117CTT49064190651110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
50NC_008117GTT49155191563130 %66.67 %33.33 %0 %7 %108796755
51NC_008117AGA493499935091166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
52NC_008117ATA496611966231366.67 %33.33 %0 %0 %7 %108796760
53NC_008117TAA498997990081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_008117ATA41000401000501166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_008117ATT41009111009211133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_008117GAT41029751029861233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108796765
57NC_008117AAT41030251030361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_008117GAA41061121061231266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796678
59NC_008117TAA41094501094601166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_008117TTA71169511169712133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_008117ATT41171441171561333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
62NC_008117AGA41177821177931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796674
63NC_008117ATA41185191185301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_008117AAT41212891213001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_008117ACA51218831218981666.67 %0 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
66NC_008117TAT41221821221921133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_008117ATA41224421224531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108796768
68NC_008117TAT41224981225101333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_008117ATA41225331225431166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_008117TCG4123001123012120 %33.33 %33.33 %33.33 %0 %108796744
71NC_008117TAA41250851250961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108796684
72NC_008117ACA51290751290891566.67 %0 %0 %33.33 %6 %108796684
73NC_008117GTA41355721355821133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %108796705
74NC_008117GAG51365081365221533.33 %0 %66.67 %0 %6 %108796705
75NC_008117CAA41382401382501166.67 %0 %0 %33.33 %9 %108796704
76NC_008117TAT51396971397101433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_008117TAA41408261408361166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_008117TAA41435791435891166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
79NC_008117ATA41439001439101166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
80NC_008117ATA41442101442211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
81NC_008117ATT41507621507731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796738
82NC_008117TTC4153896153906110 %66.67 %0 %33.33 %9 %108796737
83NC_008117AAT41541361541471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108796737
84NC_008117ATT41612891613001233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_008117ATA41614081614181166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_008117ATA41647871647991366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding