ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Staurastrum punctulatum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008116	CAA	4	1746	1756	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008116	TTA	4	9043	9054	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108796791
3	NC_008116	TGT	4	10340	10351	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008116	ACT	4	11122	11133	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	108796793
5	NC_008116	AAT	4	13103	13114	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108796792
6	NC_008116	GCT	4	13793	13803	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	108796794
7	NC_008116	CTT	4	16519	16529	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	108796795
8	NC_008116	TTA	4	20456	20467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108796853
9	NC_008116	TAA	4	21993	22004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108796853
10	NC_008116	TAG	4	23471	23481	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	108796784
11	NC_008116	TAA	4	27280	27291	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_008116	AGA	4	30734	30746	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_008116	CAA	4	30975	30986	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	108796874
14	NC_008116	AAT	4	37472	37483	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108796790
15	NC_008116	TCT	4	42477	42488	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108796827
16	NC_008116	AGA	4	51241	51251	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	108796839
17	NC_008116	AGC	4	56356	56366	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	108796848
18	NC_008116	AGA	4	57603	57614	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	108796778
19	NC_008116	TTA	4	58169	58180	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_008116	AAT	4	62361	62372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008116	ATT	4	64222	64233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108796800
22	NC_008116	TAT	4	67947	67958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008116	ATA	4	81046	81057	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108796858
24	NC_008116	AAT	4	82005	82017	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108796823
25	NC_008116	ACA	4	87640	87650	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	108796842
26	NC_008116	TTC	4	92249	92259	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	108796842
27	NC_008116	CTA	4	95636	95647	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	108796842
28	NC_008116	AGA	4	104261	104272	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	108796842
29	NC_008116	CAA	4	106235	106245	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	108796831
30	NC_008116	AAT	4	107236	107248	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108796835
31	NC_008116	TCG	4	107298	107308	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	108796846
32	NC_008116	ATA	4	108324	108334	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_008116	CTT	5	108883	108898	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
34	NC_008116	ATT	4	109349	109359	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008116	TGC	4	117174	117185	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193885687
36	NC_008116	CAG	4	122059	122070	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	108796777
37	NC_008116	TAT	4	123843	123854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108796807
38	NC_008116	AGC	4	124909	124920	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	108796807
39	NC_008116	TCA	4	125244	125254	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	108796807
40	NC_008116	ACC	4	125885	125896	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	108796806
41	NC_008116	GCA	4	126120	126131	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	108796806
42	NC_008116	TTA	4	131731	131742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_008116	CAA	4	135848	135859	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	108796786
44	NC_008116	TAT	4	136591	136601	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108796786
45	NC_008116	ACA	4	138985	138996	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	108796786
46	NC_008116	CTT	4	139765	139776	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_008116	TTC	4	140948	140959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108796782
48	NC_008116	CTT	4	149010	149022	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
49	NC_008116	TAA	5	152850	152863	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Staurastrum punctulatum chloroplast