ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008115	AAGT	3	1288	1298	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	108802623
2	NC_008115	CATT	3	4267	4278	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008115	GTTC	3	6303	6314	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008115	ATAG	3	6663	6674	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008115	CTTT	3	7349	7359	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008115	CTTT	3	9221	9232	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008115	AAAG	3	10865	10875	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008115	TTAA	4	11224	11239	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_008115	ATTT	3	11275	11286	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008115	TACG	3	11419	11430	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	108802628
11	NC_008115	TTTC	3	13561	13572	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	108802629
12	NC_008115	AAAT	3	14206	14217	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008115	TTTA	3	14279	14290	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008115	TAAA	3	14368	14380	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_008115	ATAA	3	14676	14687	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008115	ATTC	3	15213	15223	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008115	TTTC	3	15226	15237	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008115	TTTA	3	15784	15794	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_008115	TTCT	3	18646	18656	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	108802633
20	NC_008115	TTCT	4	20384	20399	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	108802633
21	NC_008115	TTCA	3	24124	24135	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	108802634
22	NC_008115	CCTA	3	26007	26017	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	108802635
23	NC_008115	CTTT	3	28842	28853	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008115	CTTG	3	29775	29786	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008115	GATT	3	29889	29900	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008115	TTCA	3	31992	32002	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008115	TTTC	3	33260	33272	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
28	NC_008115	TCTT	3	33661	33672	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008115	ATTC	3	33790	33800	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_008115	TTCA	3	33964	33975	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_008115	ATTA	4	34222	34237	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_008115	GAAA	3	37446	37457	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	108802639
33	NC_008115	TTGC	3	37847	37857	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	108802639
34	NC_008115	ATTT	3	39645	39655	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008115	AATG	3	43750	43761	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	108802643
36	NC_008115	TATC	3	46713	46723	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	108802644
37	NC_008115	TAAG	3	46730	46741	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	108802644
38	NC_008115	CTTT	3	46995	47005	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	108802644
39	NC_008115	CTTT	3	47902	47913	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	108802644
40	NC_008115	ATAA	3	49994	50005	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_008115	TTTC	3	52711	52721	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_008115	TTTG	3	53579	53589	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_008115	GTCT	3	54077	54088	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	108802647
44	NC_008115	ATTT	3	55058	55069	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_008115	TCTT	3	55382	55392	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_008115	TTTC	3	58673	58683	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
47	NC_008115	TGCA	3	59993	60005	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	108802651
48	NC_008115	CTTT	4	62849	62863	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
49	NC_008115	TCTT	3	63043	63054	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_008115	TTAT	3	63211	63221	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_008115	AAAC	3	63945	63956	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_008115	AATA	3	66392	66404	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008115	TTCT	3	68696	68706	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008115	CTTG	3	69474	69484	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_008115	TGAT	3	70309	70320	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_008115	AATT	3	70978	70989	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008115	GTTT	3	72231	72241	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008115	ATTT	3	72250	72261	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008115	ATAA	4	73018	73033	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	108802664
60	NC_008115	TGAA	3	73662	73673	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	108802665
61	NC_008115	TTTC	3	73696	73708	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
62	NC_008115	GATA	3	74299	74310	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_008115	CCTT	3	74319	74329	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
64	NC_008115	GTAA	3	74639	74649	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	108802702
65	NC_008115	TTTA	3	75202	75213	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	108802702
66	NC_008115	TTTC	3	82895	82905	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	108802702
67	NC_008115	TTCT	3	84756	84767	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	108802702
68	NC_008115	AAAT	3	85985	85995	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	108802702
69	NC_008115	GAAT	3	86779	86790	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	108802702
70	NC_008115	TTCT	3	87112	87123	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	108802702
71	NC_008115	CAAT	3	87603	87613	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	108802702
72	NC_008115	ACTA	3	88411	88421	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	108802702
73	NC_008115	TTCT	4	92647	92661	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	108802702
74	NC_008115	CTTT	3	93844	93854	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	108802702
75	NC_008115	TGAT	3	95669	95681	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	108802702
76	NC_008115	TGAT	3	95711	95723	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	108802702
77	NC_008115	AATA	3	96558	96570	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	108802702
78	NC_008115	AATA	3	98407	98418	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	108802702
79	NC_008115	TGGG	3	98851	98862	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	108802702
80	NC_008115	ATCC	3	107759	107770	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	108802702
81	NC_008115	CTAT	3	108156	108167	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	108802702
82	NC_008115	AAGG	3	108298	108308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	108802702
83	NC_008115	GAGG	3	111024	111035	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	108802702
84	NC_008115	AGGT	3	111236	111247	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	108802702
85	NC_008115	TAAG	3	112356	112366	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	108802702
86	NC_008115	AAAT	3	115431	115441	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	108802702
87	NC_008115	ATAG	3	117640	117651	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	108802702
88	NC_008115	GAAA	3	121027	121038	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	108802702
89	NC_008115	AAGA	3	121435	121446	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	108802702
90	NC_008115	AAAG	3	122521	122531	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	108802702
91	NC_008115	TAAT	3	123108	123119	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	108802702
92	NC_008115	TATT	4	123126	123141	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	108802702
93	NC_008115	AATC	3	126575	126586	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	108802702
94	NC_008115	TGAA	3	126718	126728	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	108802702
95	NC_008115	AATA	3	128622	128633	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	108802702
96	NC_008115	TTCT	4	130117	130131	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	108802702
97	NC_008115	TTTA	3	130851	130861	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	108802702
98	NC_008115	TAAT	3	131008	131019	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	108802702
99	NC_008115	AAGA	3	131268	131279	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	108802702
100	NC_008115	TTTC	3	132671	132681	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	108802702
101	NC_008115	AAAG	3	132772	132782	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	108802702
102	NC_008115	AAAG	3	135883	135893	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	108802702
103	NC_008115	CTTA	3	136914	136924	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	108802702
104	NC_008115	CCTT	3	140972	140982	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	108802702
105	NC_008115	GGAT	3	141510	141521	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	108802702
106	NC_008115	ATCA	3	153599	153611	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	108802705
107	NC_008115	AAAG	3	155426	155436	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	108802705
108	NC_008115	TATT	3	156491	156502	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	108802705

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast