ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pseudendoclonium akinetum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008114AAG44614711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %108796876
2NC_008114ATT4221022221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %108796876
3NC_008114ATT4408941011333.33 %66.67 %0 %0 %7 %108796876
4NC_008114ATT410883108951333.33 %66.67 %0 %0 %7 %108796877
5NC_008114TCT41162311633110 %66.67 %0 %33.33 %9 %108796877
6NC_008114CAA414877148871166.67 %0 %0 %33.33 %9 %108796878
7NC_008114CTC42694726957110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
8NC_008114CTG43653936550120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %108796891
9NC_008114AAT437510375201166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796892
10NC_008114TCT43966539676120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_008114CAA445661456711166.67 %0 %0 %33.33 %9 %108796894
12NC_008114ATA450438504481166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_008114AAT450957509681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_008114ATA452698527091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %157011969
15NC_008114GAA853240532632466.67 %0 %33.33 %0 %8 %157011969
16NC_008114TAA455774557861366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_008114TAA455868558801366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_008114TTC55963859652150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
19NC_008114CAA459684596951266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_008114TAA462271622811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_008114AAG462438624491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796902
22NC_008114ATT565863658761433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_008114ATT471969719801233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796909
24NC_008114TTA473380733911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796909
25NC_008114AAG477353773641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796909
26NC_008114GAT478843788531133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %108796909
27NC_008114AGA480060800711266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108796917
28NC_008114AGA481564815741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %108796918
29NC_008114ATT481945819551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108796919
30NC_008114ATT486075860851133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_008114ACG487646876561133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %108796921
32NC_008114TTA489975899861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_008114ATT590343903571533.33 %66.67 %0 %0 %6 %108796979
34NC_008114TCT49823398243110 %66.67 %0 %33.33 %9 %108796980
35NC_008114CTT49995799968120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108796926
36NC_008114GTT4102744102754110 %66.67 %33.33 %0 %9 %108796929
37NC_008114TAA41082501082601166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_008114CAT41137821137921133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %108796935
39NC_008114GAT41147021147121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %108796935
40NC_008114TTC4116334116345120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108796935
41NC_008114TGC4119058119069120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
42NC_008114GTT4121565121576120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108796943
43NC_008114ATA41246881246991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_008114TAT41279031279131133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
45NC_008114TAT41293511293611133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
46NC_008114TAA41302001302111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_008114TAA41324871324971166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796952
48NC_008114TAG41400881400981133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
49NC_008114CAC41402481402591233.33 %0 %0 %66.67 %8 %108796957
50NC_008114ATT41490181490281133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_008114ACA41540031540141266.67 %0 %0 %33.33 %8 %108796960
52NC_008114GTT4155413155424120 %66.67 %33.33 %0 %0 %108796960
53NC_008114TAA41558201558301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_008114TAA41558431558531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_008114ATA41598861598971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108796963
56NC_008114TAA41634311634411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
57NC_008114TTA51663391663531533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
58NC_008114ATT41674081674191233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108796966
59NC_008114ATT41760261760381333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_008114TTA41771201771301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_008114TAA41793141793251266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_008114ATA41813981814081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796974
63NC_008114AAT41842631842731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108796974
64NC_008114GTT4187386187397120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108796977
65NC_008114AAT41879551879671366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_008114ATA41881101881201166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_008114ATA41882801882921366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
68NC_008114ATA41884491884611366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_008114ATA41884731884851366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_008114ATA41884971885091366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
71NC_008114ATA41885271885371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_008114ATA41885451885551166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
73NC_008114ATA41885631885731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_008114TAA41885981886091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_008114TAA41886271886381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_008114ATA51887521887651466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_008114TAT41890971891081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_008114TAT51891591891731533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
79NC_008114CTT4190298190308110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding