ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Helicosporidium sp. ex Simulium jonesii plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008100	ATG	4	2822	2833	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	108773397
2	NC_008100	ATA	4	3790	3801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108773398
3	NC_008100	TAA	4	4856	4866	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108773399
4	NC_008100	TTA	4	4874	4885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108773399
5	NC_008100	GAA	4	6417	6428	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	108773399
6	NC_008100	ATT	4	7448	7458	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108773399
7	NC_008100	GAG	4	8908	8919	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	108773400
8	NC_008100	TAG	4	9209	9220	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	108773400
9	NC_008100	ATA	4	10020	10030	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108773422
10	NC_008100	ATT	4	10652	10663	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108773422
11	NC_008100	ATG	4	11815	11826	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	108773422
12	NC_008100	TAA	7	12602	12622	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108773422
13	NC_008100	TCA	4	13095	13105	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	108773401
14	NC_008100	TAA	4	15759	15771	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108773403
15	NC_008100	AAT	4	15785	15796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108773403
16	NC_008100	TAT	4	22779	22789	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108773405
17	NC_008100	TTA	6	22981	22999	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	108773405
18	NC_008100	AAT	4	24221	24232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108773405
19	NC_008100	TAT	4	26722	26733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108773406
20	NC_008100	GAA	4	28086	28098	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	108773406
21	NC_008100	AAT	4	28412	28422	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108773406
22	NC_008100	TTC	4	28807	28818	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773407
23	NC_008100	ATA	4	29286	29296	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	108773408
24	NC_008100	TAT	4	29400	29410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108773408
25	NC_008100	TAT	4	29473	29483	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	108773408
26	NC_008100	GTT	4	29728	29738	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	108773408
27	NC_008100	AAT	4	32387	32399	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108773415
28	NC_008100	CTT	4	34867	34878	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773418
29	NC_008100	ATA	4	36815	36827	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Helicosporidium sp. ex Simulium jonesii plastid