ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oltmannsiellopsis viridis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008099ATT4188618971233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_008099CTT440264036110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
3NC_008099TAA4692869381166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_008099CTT476917701110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_008099AGT4947594861233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108773367
6NC_008099ATT410137101481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108773367
7NC_008099GTG41274612756110 %33.33 %66.67 %0 %9 %108773371
8NC_008099TTA413466134761133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
9NC_008099GTT41596715978120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108773374
10NC_008099TAT424931249431333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_008099TTC42573925750120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
12NC_008099TGT42740927420120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108773385
13NC_008099TTC42762727638120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108773385
14NC_008099TCT43488634896110 %66.67 %0 %33.33 %9 %108773386
15NC_008099TTA436797368071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_008099ATG438635386461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108773389
17NC_008099GTG53886138875150 %33.33 %66.67 %0 %6 %108773389
18NC_008099CAC439692397031233.33 %0 %0 %66.67 %8 %108773389
19NC_008099ATC445454454641133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
20NC_008099TAT556455564681433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_008099GTT45672756738120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
22NC_008099TAA558772587861566.67 %33.33 %0 %0 %6 %108773307
23NC_008099TCT45983359844120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
24NC_008099TTA460351603611133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_008099AAT460364603741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_008099CAA462727627371166.67 %0 %0 %33.33 %9 %108773308
27NC_008099ATT471341713521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_008099ACT473015730261233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108773314
29NC_008099CTA475688756991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
30NC_008099GTT47747677486110 %66.67 %33.33 %0 %9 %108773317
31NC_008099AGT478422784331233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108773317
32NC_008099ATT478557785681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108773317
33NC_008099AAC480795808061266.67 %0 %0 %33.33 %8 %108773317
34NC_008099GAA482211822221266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
35NC_008099ATG582498825111433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %108773318
36NC_008099CAA483217832281266.67 %0 %0 %33.33 %8 %108773318
37NC_008099TGT48875788768120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108773319
38NC_008099TAA488920889321366.67 %33.33 %0 %0 %7 %108773319
39NC_008099GTT49125591265110 %66.67 %33.33 %0 %9 %108773320
40NC_008099TGT49508195093130 %66.67 %33.33 %0 %7 %108773323
41NC_008099GTG49584395853110 %33.33 %66.67 %0 %9 %108773323
42NC_008099GTT59854698560150 %66.67 %33.33 %0 %6 %108773324
43NC_008099AAT498649986601266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108773324
44NC_008099GTT49968499695120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108773324
45NC_008099TGT4105027105038120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108773330
46NC_008099TAC41060881060991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108773331
47NC_008099AAG41123471123571166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
48NC_008099TCT5112379112393150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
49NC_008099ATT41138931139031133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
50NC_008099AAC41143481143591266.67 %0 %0 %33.33 %8 %108773336
51NC_008099ATA41190841190941166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_008099CCA41240811240911133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
53NC_008099TAT41250801250911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108773343
54NC_008099ATT41252401252511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108773343
55NC_008099TCT4127286127297120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108773344
56NC_008099AGT41305681305781133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
57NC_008099ATT41333121333221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108773349
58NC_008099GTA41385401385521333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
59NC_008099GAT41400801400901133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
60NC_008099GTG4145841145852120 %33.33 %66.67 %0 %8 %108773355
61NC_008099ATC41468991469101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108773355
62NC_008099ATT41474681474791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_008099TAA41487371487471166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
64NC_008099AAG41506471506581266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108773358