ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Chara vulgaris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008097	ATAAAT	3	6495	6512	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108773279
2	NC_008097	TAAATA	3	6518	6535	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108773279
3	NC_008097	AAATCA	3	8214	8232	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	108773279
4	NC_008097	ATATAA	3	8546	8563	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108773279
5	NC_008097	TACTAT	4	20701	20725	25	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	4 %	108773279
6	NC_008097	CATATA	3	24389	24406	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	108773279
7	NC_008097	TATTTA	3	26030	26048	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
8	NC_008097	TTATAT	3	30500	30516	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
9	NC_008097	TGTATA	3	34772	34789	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	108773279
10	NC_008097	ATATTA	3	42973	42989	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
11	NC_008097	TATGTA	3	47838	47856	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	108773279
12	NC_008097	TATAAT	3	48117	48134	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
13	NC_008097	TTATAT	5	48285	48313	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	108773279
14	NC_008097	TATTTT	3	50986	51004	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	108773279
15	NC_008097	TATGTA	4	55947	55970	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	0 %	108773279
16	NC_008097	CATATT	3	62257	62275	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	108773279
17	NC_008097	TATATT	3	64983	65000	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
18	NC_008097	AATATA	3	66513	66531	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	108773279
19	NC_008097	TCAAAT	4	68492	68515	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	108773279
20	NC_008097	ATAAAT	3	69637	69654	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	108773279
21	NC_008097	TGTAAT	3	71037	71055	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	108773279
22	NC_008097	TATATT	3	74646	74663	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
23	NC_008097	TATAAT	3	78595	78612	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
24	NC_008097	TTATAT	3	88186	88203	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
25	NC_008097	AATAAA	3	91820	91836	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
26	NC_008097	TAATTT	3	93074	93091	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	108773279
27	NC_008097	AAACAA	3	96197	96214	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	108773279
28	NC_008097	CAATAT	3	98430	98446	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	108773279
29	NC_008097	TATAAT	3	105030	105047	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
30	NC_008097	ATATTG	3	118018	118034	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_008097	AATTAT	3	120209	120227	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_008097	TATTTA	4	122201	122223	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
33	NC_008097	TATTCT	4	123106	123127	22	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008097	TATTTA	5	123870	123900	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008097	AATTAT	3	130876	130894	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	108773249
36	NC_008097	ATATTA	4	132492	132515	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	108773249
37	NC_008097	ATTTGA	3	136674	136690	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_008097	TCTAAT	3	141384	141400	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
39	NC_008097	AATTAG	3	141398	141415	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_008097	TATAAT	3	153640	153656	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_008097	TTATAT	3	160940	160958	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	108773218
42	NC_008097	ATATTA	5	165870	165900	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_008097	TCTAAT	3	179333	179350	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
44	NC_008097	TCAAAT	3	184059	184075	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Chara vulgaris chloroplast