ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Chara vulgaris chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008097	TA	6	75	85	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008097	AT	6	451	462	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008097	AT	6	3246	3257	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
4	NC_008097	AT	6	3353	3363	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
5	NC_008097	TA	6	3655	3665	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
6	NC_008097	TA	6	3811	3821	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
7	NC_008097	AT	7	3996	4010	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
8	NC_008097	AT	6	4014	4025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
9	NC_008097	AG	11	4024	4047	24	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	108773279
10	NC_008097	TA	6	6013	6023	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
11	NC_008097	TA	6	6362	6372	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
12	NC_008097	AT	7	7232	7244	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
13	NC_008097	AT	8	7298	7312	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
14	NC_008097	TA	6	7576	7586	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
15	NC_008097	TA	6	9396	9406	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
16	NC_008097	TA	6	9412	9424	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
17	NC_008097	AT	6	13501	13511	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
18	NC_008097	AT	7	13514	13526	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
19	NC_008097	AT	7	13554	13566	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
20	NC_008097	TA	9	20740	20756	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
21	NC_008097	TA	7	20760	20772	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
22	NC_008097	TA	6	22139	22149	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
23	NC_008097	AT	7	22433	22446	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
24	NC_008097	AT	6	22636	22646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
25	NC_008097	TA	7	23937	23949	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
26	NC_008097	TA	7	24141	24153	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
27	NC_008097	AT	7	24319	24332	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
28	NC_008097	AT	7	24409	24424	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
29	NC_008097	TA	7	24425	24440	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
30	NC_008097	AT	6	24865	24875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
31	NC_008097	AT	9	25996	26013	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
32	NC_008097	TA	6	27358	27368	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
33	NC_008097	TA	6	30099	30110	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
34	NC_008097	AC	6	31990	32000	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	108773279
35	NC_008097	AT	6	32876	32886	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
36	NC_008097	AT	6	32909	32920	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
37	NC_008097	AT	6	32925	32935	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
38	NC_008097	TA	6	32991	33003	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
39	NC_008097	TA	6	36269	36282	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
40	NC_008097	TA	6	36294	36305	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
41	NC_008097	AT	6	36404	36414	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
42	NC_008097	TA	7	40787	40800	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
43	NC_008097	AG	6	43544	43554	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	108773279
44	NC_008097	AT	8	44528	44542	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
45	NC_008097	AT	6	45162	45172	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
46	NC_008097	AT	7	45287	45299	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
47	NC_008097	TA	6	45989	46002	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
48	NC_008097	TA	7	46007	46019	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
49	NC_008097	TA	6	46023	46033	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
50	NC_008097	TC	6	46122	46133	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	108773279
51	NC_008097	TA	8	47388	47403	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
52	NC_008097	TA	29	47410	47465	56	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
53	NC_008097	TA	10	47413	47434	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
54	NC_008097	TA	7	48178	48190	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
55	NC_008097	TA	6	48767	48777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
56	NC_008097	TA	6	52461	52472	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
57	NC_008097	TA	6	55990	56000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
58	NC_008097	AT	8	56015	56030	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
59	NC_008097	TA	6	58001	58012	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
60	NC_008097	AT	6	58015	58027	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
61	NC_008097	TA	18	58027	58060	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
62	NC_008097	AT	6	58383	58394	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
63	NC_008097	TA	7	59190	59203	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
64	NC_008097	AT	7	59648	59660	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
65	NC_008097	AT	6	59671	59682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
66	NC_008097	TA	6	62283	62295	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
67	NC_008097	TA	8	62300	62314	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
68	NC_008097	AT	6	62318	62328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
69	NC_008097	TA	6	62332	62342	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
70	NC_008097	AT	7	62436	62448	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
71	NC_008097	AT	8	62469	62483	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773279
72	NC_008097	AT	6	64470	64481	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
73	NC_008097	TA	7	64497	64510	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
74	NC_008097	AT	6	64970	64982	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
75	NC_008097	AT	6	65031	65041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
76	NC_008097	TA	6	68936	68946	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
77	NC_008097	AT	6	69340	69351	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
78	NC_008097	AT	6	69458	69469	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
79	NC_008097	TA	6	69698	69709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
80	NC_008097	AT	10	69930	69949	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	108773279
81	NC_008097	TA	6	70031	70042	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
82	NC_008097	AT	7	71210	71222	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
83	NC_008097	AT	6	71225	71235	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
84	NC_008097	AT	6	74620	74630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
85	NC_008097	AT	7	74636	74648	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
86	NC_008097	AT	13	74690	74714	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
87	NC_008097	AT	14	74717	74742	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
88	NC_008097	TA	6	75272	75283	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
89	NC_008097	TA	6	75657	75668	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
90	NC_008097	TA	6	75701	75712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
91	NC_008097	AT	7	77979	77992	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
92	NC_008097	AT	6	78462	78474	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
93	NC_008097	AT	7	79991	80003	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
94	NC_008097	TA	6	80616	80627	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
95	NC_008097	TA	6	80754	80764	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
96	NC_008097	AT	6	85302	85313	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
97	NC_008097	CT	6	85448	85458	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	108773279
98	NC_008097	AT	6	85718	85730	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
99	NC_008097	AT	6	86401	86412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
100	NC_008097	TA	7	86952	86965	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
101	NC_008097	TA	7	87182	87195	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
102	NC_008097	GA	6	91590	91601	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	108773279
103	NC_008097	TA	7	92304	92316	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
104	NC_008097	AT	6	93432	93442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
105	NC_008097	AT	6	94329	94339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
106	NC_008097	TA	6	95436	95446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
107	NC_008097	AT	6	97121	97131	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
108	NC_008097	TA	8	97134	97150	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
109	NC_008097	TA	6	97179	97191	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
110	NC_008097	AT	6	97192	97204	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
111	NC_008097	AT	7	97212	97224	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773279
112	NC_008097	AT	6	97261	97272	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
113	NC_008097	TA	6	98200	98211	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
114	NC_008097	AT	9	98224	98240	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	108773279
115	NC_008097	AT	6	104934	104944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
116	NC_008097	AT	6	105400	105411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
117	NC_008097	TA	6	105658	105669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773279
118	NC_008097	AT	6	105748	105758	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
119	NC_008097	TA	10	107163	107182	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	108773279
120	NC_008097	AT	6	109212	109222	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773279
121	NC_008097	TA	6	111237	111247	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773205
122	NC_008097	TA	7	111250	111262	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773205
123	NC_008097	TA	6	111361	111374	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773205
124	NC_008097	TA	6	111376	111387	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773205
125	NC_008097	TA	6	112641	112651	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_008097	TA	8	117120	117134	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_008097	TA	8	120274	120288	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_008097	TA	6	120299	120311	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_008097	TA	7	122173	122186	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_008097	AT	6	123037	123048	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_008097	AT	6	123058	123069	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_008097	TA	8	123392	123406	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_008097	TA	6	123759	123769	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_008097	TA	6	123916	123926	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_008097	AT	13	125017	125040	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_008097	AT	7	125045	125057	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_008097	AT	6	125405	125417	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_008097	AT	6	126904	126914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_008097	AT	6	128600	128611	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773252
140	NC_008097	TA	7	130895	130907	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773249
141	NC_008097	AT	7	131136	131151	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773249
142	NC_008097	AT	6	131162	131174	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773249
143	NC_008097	AT	6	131173	131183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773249
144	NC_008097	AT	8	131280	131294	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	108773249
145	NC_008097	TA	7	131336	131349	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773249
146	NC_008097	TA	6	132272	132283	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	108773249
147	NC_008097	AT	7	132801	132814	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773249
148	NC_008097	TA	7	132855	132867	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773249
149	NC_008097	TA	6	132885	132895	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	108773249
150	NC_008097	TA	6	134054	134065	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_008097	AT	6	134162	134172	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_008097	TC	6	134815	134826	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
153	NC_008097	TA	14	134825	134852	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
154	NC_008097	AT	6	148624	148637	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
155	NC_008097	AT	7	148639	148653	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
156	NC_008097	TA	6	150555	150566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
157	NC_008097	AT	6	150612	150622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_008097	TA	6	151181	151193	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
159	NC_008097	TA	6	151215	151227	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
160	NC_008097	TA	7	151528	151541	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_008097	AT	6	155368	155381	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
162	NC_008097	TA	8	155746	155760	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
163	NC_008097	AT	6	155963	155973	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_008097	TA	9	157822	157838	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
165	NC_008097	AT	8	157850	157865	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
166	NC_008097	TA	7	159193	159205	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
167	NC_008097	AT	22	159826	159866	41	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
168	NC_008097	TA	7	159958	159973	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
169	NC_008097	AT	8	159988	160003	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
170	NC_008097	AT	6	160994	161006	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773218
171	NC_008097	AT	7	161367	161379	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	108773218
172	NC_008097	TA	6	164090	164103	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
173	NC_008097	TA	6	164395	164406	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
174	NC_008097	TA	6	165085	165095	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
175	NC_008097	AT	6	165193	165205	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
176	NC_008097	TA	6	165370	165383	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
177	NC_008097	AT	6	166542	166552	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Chara vulgaris chloroplast