ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Chara vulgaris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008097	AAT	4	3751	3762	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
2	NC_008097	AG	9	4024	4041	18	50 %	0 %	50 %	0 %	108773279
3	NC_008097	TCTT	3	4847	4858	12	0 %	75 %	0 %	25 %	108773279
4	NC_008097	TTTA	3	5335	5346	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
5	NC_008097	TAA	4	7313	7324	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
6	NC_008097	TATT	3	7686	7697	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
7	NC_008097	TAT	4	8348	8359	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108773279
8	NC_008097	ATAAA	3	9995	10009	15	80 %	20 %	0 %	0 %	108773279
9	NC_008097	ATA	4	20660	20671	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
10	NC_008097	ATA	5	22613	22627	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
11	NC_008097	AT	6	24321	24332	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
12	NC_008097	AT	7	24409	24422	14	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
13	NC_008097	TA	7	24425	24438	14	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
14	NC_008097	AT	6	25996	26007	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
15	NC_008097	ATAA	3	29839	29850	12	75 %	25 %	0 %	0 %	108773279
16	NC_008097	TAT	5	30361	30375	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108773279
17	NC_008097	TATT	3	31589	31600	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
18	NC_008097	ATATA	3	34614	34628	15	60 %	40 %	0 %	0 %	108773279
19	NC_008097	TATAT	3	34741	34755	15	40 %	60 %	0 %	0 %	108773279
20	NC_008097	TA	6	36269	36280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
21	NC_008097	ATT	4	38402	38413	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108773279
22	NC_008097	TATT	3	39732	39743	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
23	NC_008097	TA	6	45989	46000	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
24	NC_008097	TA	9	47415	47432	18	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
25	NC_008097	TA	14	47436	47463	28	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
26	NC_008097	AATG	3	53353	53364	12	50 %	25 %	25 %	0 %	108773279
27	NC_008097	TATGTA	4	55947	55970	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108773279
28	NC_008097	AT	7	56015	56028	14	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
29	NC_008097	AT	11	58036	58057	22	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
30	NC_008097	ATAA	3	59615	59626	12	75 %	25 %	0 %	0 %	108773279
31	NC_008097	ATA	4	59820	59831	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
32	NC_008097	AT	6	62469	62480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
33	NC_008097	TATT	3	64523	64534	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
34	NC_008097	TTATAT	3	64982	64999	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108773279
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36	NC_008097	ATATA	3	71182	71196	15	60 %	40 %	0 %	0 %	108773279
37	NC_008097	AT	10	74691	74710	20	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
38	NC_008097	AT	9	74718	74735	18	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
39	NC_008097	TTATAA	3	78594	78611	18	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
40	NC_008097	TA	7	97134	97147	14	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
41	NC_008097	AT	6	98229	98240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773279
42	NC_008097	TGTA	3	98483	98494	12	25 %	50 %	25 %	0 %	108773279
43	NC_008097	TTAT	3	99775	99786	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
44	NC_008097	TATT	3	100365	100376	12	25 %	75 %	0 %	0 %	108773279
45	NC_008097	ATA	4	103293	103304	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773279
46	NC_008097	TAAA	4	103861	103876	16	75 %	25 %	0 %	0 %	108773279
47	NC_008097	AAAT	3	106997	107008	12	75 %	25 %	0 %	0 %	108773279
48	NC_008097	AATA	3	117207	117218	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008097	TAATA	3	118074	118088	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008097	ATA	4	118115	118126	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008097	ATATA	3	119718	119732	15	60 %	40 %	0 %	0 %	108773300
52	NC_008097	TA	6	120299	120310	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008097	ATT	4	123143	123154	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008097	ATA	4	124066	124077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008097	AT	9	125020	125037	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008097	ATA	4	126830	126841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008097	AATAT	3	126852	126866	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008097	ATA	4	130913	130924	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773249
59	NC_008097	TAT	4	130927	130938	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108773249
60	NC_008097	AT	6	131280	131291	12	50 %	50 %	0 %	0 %	108773249
61	NC_008097	ATA	4	132233	132244	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773249
62	NC_008097	ATA	4	132250	132261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108773249
63	NC_008097	TA	7	134825	134838	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008097	AGGT	3	143136	143147	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008097	ATTT	3	146240	146251	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_008097	TTA	4	153297	153308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008097	TAA	4	153360	153371	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008097	ATATT	3	153530	153544	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008097	AT	6	155368	155379	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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