ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Solanum tuberosum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008096	TAT	4	198	209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008096	TTA	4	2048	2059	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008096	AAG	5	3022	3036	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	108773111
4	NC_008096	GAA	4	4445	4456	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008096	TTA	4	10009	10020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008096	ATT	4	24014	24026	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	108773121
7	NC_008096	CAG	4	28692	28703	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008096	TTA	4	28862	28872	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008096	TTA	4	29215	29226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008096	TAG	4	32234	32245	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_008096	ATT	4	32344	32354	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008096	TTC	4	36038	36049	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773126
13	NC_008096	TAG	4	45089	45099	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	108773131
14	NC_008096	GTA	4	45673	45683	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008096	AAT	4	46547	46558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008096	TAT	4	52333	52343	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008096	ATT	5	52345	52360	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_008096	AGA	4	52427	52438	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008096	TTA	4	52747	52758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008096	ATA	4	55716	55729	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108773137
21	NC_008096	TTA	5	58362	58377	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_008096	TAA	4	58540	58550	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008096	TTA	4	60685	60696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008096	GTT	4	66933	66943	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_008096	TCT	4	75564	75575	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773194
26	NC_008096	AGA	4	78611	78621	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	108773194
27	NC_008096	TTA	4	85519	85530	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108773194
28	NC_008096	CTT	4	85926	85937	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773194
29	NC_008096	GAT	4	86393	86403	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	108773194
30	NC_008096	GAT	4	87767	87777	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	108773194
31	NC_008096	TGA	4	92521	92532	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	108773194
32	NC_008096	TTC	4	100266	100277	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	108773195
33	NC_008096	AAT	4	111256	111267	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108773195
34	NC_008096	ATT	4	112061	112073	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	108773195
35	NC_008096	TAA	4	112475	112486	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	108773195
36	NC_008096	AAG	4	112700	112711	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	108773195
37	NC_008096	ATA	4	120206	120218	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	108773195
38	NC_008096	TTC	5	121328	121342	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	108773195
39	NC_008096	TTA	4	129768	129779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	108773195
40	NC_008096	GAA	4	140757	140768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	108773195
41	NC_008096	ATC	4	153257	153267	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_008096	ATC	4	154631	154641	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	108773193
43	NC_008096	GAA	5	155096	155110	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	108773193

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Solanum tuberosum chloroplast