ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hynobius formosanus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008084	TTA	4	89	101	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008084	CTCA	3	646	656	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008084	AATG	3	1556	1566	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008084	AAT	4	1808	1819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008084	TAAA	3	2310	2320	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008084	GTTC	3	2472	2483	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008084	TAAT	3	2767	2777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991102
8	NC_008084	ACC	4	3505	3516	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	107991102
9	NC_008084	TTAA	3	3537	3547	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991102
10	NC_008084	TAA	4	4527	4538	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	107991103
11	NC_008084	AAT	4	4654	4665	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	107991103
12	NC_008084	TTAA	3	4949	4959	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991103
13	NC_008084	TTTA	3	4960	4971	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	107991103
14	NC_008084	AGG	4	6020	6031	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	107991104
15	NC_008084	TTTA	4	6381	6396	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	107991104
16	NC_008084	AATT	3	7885	7895	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991106
17	NC_008084	TAA	4	8201	8212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107991107
18	NC_008084	CAA	4	8246	8256	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	107991107
19	NC_008084	TTA	4	8387	8398	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107991107
20	NC_008084	CAT	4	9328	9338	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	107991108
21	NC_008084	TAATTA	4	9505	9528	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	107991109
22	NC_008084	GATT	3	9866	9876	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008084	ATT	4	10548	10558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107991111
24	NC_008084	AT	6	11426	11436	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991111
25	NC_008084	CTA	4	11685	11697	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
26	NC_008084	AATTT	3	11797	11812	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	107991112
27	NC_008084	TAAAT	3	11870	11883	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	107991112
28	NC_008084	TAG	4	12548	12559	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	107991112
29	NC_008084	TGTC	3	12614	12625	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	107991112
30	NC_008084	TAA	4	12728	12739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107991112
31	NC_008084	TAT	4	13191	13202	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107991112
32	NC_008084	AT	6	13546	13556	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107991112
33	NC_008084	ATT	4	13585	13595	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107991112
34	NC_008084	AT	6	14511	14522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	107991114
35	NC_008084	CTT	4	14782	14793	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	107991114
36	NC_008084	TTAA	3	14890	14902	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	107991114
37	NC_008084	TTTC	3	15479	15490	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_008084	CAC	4	15541	15552	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
39	NC_008084	T	12	15931	15942	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hynobius formosanus mitochondrion