ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Schistosoma spindale mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008067	AATT	3	849	860	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	107735981
2	NC_008067	TATG	3	1530	1540	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	107735981
3	NC_008067	TAGTAT	3	1676	1693	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	107735981
4	NC_008067	TAT	4	1857	1867	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107735981
5	NC_008067	AGT	4	1925	1937	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	107735981
6	NC_008067	ATT	4	2010	2021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107735982
7	NC_008067	TAT	4	2060	2070	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107735982
8	NC_008067	TAT	4	2585	2595	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107735983
9	NC_008067	TTA	4	3063	3074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107735983
10	NC_008067	TTA	4	3309	3320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	107735983
11	NC_008067	AATT	3	3876	3886	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107735984
12	NC_008067	ATT	4	3913	3924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107735984
13	NC_008067	T	26	3971	3996	26	0 %	100 %	0 %	0 %	3 %	107735984
14	NC_008067	GA	7	4824	4837	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	107735985
15	NC_008067	TA	8	5463	5477	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_008067	TA	8	6225	6239	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_008067	TA	8	7168	7182	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_008067	TGT	4	7560	7571	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008067	TTTA	3	7576	7586	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_008067	ATT	4	7664	7674	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_008067	TAG	4	7708	7718	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008067	ATT	4	7761	7771	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008067	ATA	5	8064	8078	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_008067	T	13	8475	8487	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	159106774
25	NC_008067	TGG	4	8923	8934	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	159106774
26	NC_008067	TAA	4	10582	10592	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008067	TATTT	3	10669	10683	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_008067	ATT	4	11104	11114	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_008067	TAG	4	11154	11164	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_008067	TTA	5	12521	12535	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	107735986
31	NC_008067	ATT	4	13049	13059	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_008067	AGAAAT	3	13521	13539	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	107735989
33	NC_008067	T	17	14360	14376	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	107735987
34	NC_008067	TA	6	14703	14713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107735987
35	NC_008067	AAT	4	14997	15008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_008067	GTAG	3	15277	15287	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	107735988
37	NC_008067	AAATTG	3	15352	15369	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	107735988
38	NC_008067	TA	6	16338	16348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107735988
39	NC_008067	TCTA	3	16513	16524	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	107735988
40	NC_008067	TA	6	16576	16586	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107735988
41	NC_008067	TTAT	3	16808	16819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Schistosoma spindale mitochondrion