ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nephila clavata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008063	TTTG	3	126	136	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	107736180
2	NC_008063	ATTC	3	485	495	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	107736180
3	NC_008063	AAT	4	666	676	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	107736180
4	NC_008063	TTG	4	734	745	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	107736180
5	NC_008063	ATT	4	750	761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107736180
6	NC_008063	TCT	4	936	947	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	107736181
7	NC_008063	TATTTT	3	1093	1111	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	107736181
8	NC_008063	ATA	4	1533	1545	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	107736182
9	NC_008063	AGA	4	2150	2160	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	107736182
10	NC_008063	AAG	4	2873	2884	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	107736182
11	NC_008063	AATA	5	3240	3259	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	107736183
12	NC_008063	ATA	5	3353	3366	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	107736183
13	NC_008063	TTA	4	3401	3412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107736183
14	NC_008063	TAA	4	3993	4003	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	107736183
15	NC_008063	TA	6	4401	4412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	107736183
16	NC_008063	TCA	4	4686	4696	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	107736184
17	NC_008063	GTA	4	4956	4967	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	107736185
18	NC_008063	AAAG	3	5061	5071	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	107736185
19	NC_008063	ATTT	3	6090	6100	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	107736186
20	NC_008063	AAATA	3	6955	6968	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	107736187
21	NC_008063	GAAA	3	6974	6984	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	107736187
22	NC_008063	AAT	4	7160	7171	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107736187
23	NC_008063	ATTA	3	7760	7771	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008063	TAAA	3	7821	7832	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008063	T	13	8070	8082	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_008063	TAA	4	8150	8160	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008063	TAAA	3	8524	8534	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_008063	T	13	8742	8754	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008063	TTATA	3	9049	9062	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_008063	T	18	9485	9502	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008063	C	33	9663	9695	33	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
32	NC_008063	A	18	9697	9714	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_008063	TAT	4	9782	9792	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008063	TA	6	9812	9822	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008063	TATG	4	9825	9840	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_008063	TA	14	9837	9864	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_008063	TAT	4	9913	9923	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_008063	TA	9	9948	9965	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_008063	AATT	3	10345	10357	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	107736188
40	NC_008063	ATCA	3	10693	10704	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	107736188
41	NC_008063	TA	6	10809	10819	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107736188
42	NC_008063	TAA	5	10983	10997	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	107736188
43	NC_008063	TAA	4	11013	11024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107736188
44	NC_008063	TTA	5	12691	12705	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	107736189
45	NC_008063	ATAATT	4	12946	12969	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	107736190
46	NC_008063	TTAAA	3	13507	13521	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	107736190
47	NC_008063	CTT	4	13799	13810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	107736192
48	NC_008063	TTTTCT	3	13835	13853	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	107736192
49	NC_008063	TAT	4	14408	14418	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	107736192

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nephila clavata mitochondrion