ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Strelkovimermis spiculatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008047	GAG	4	659	670	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	99878741
2	NC_008047	AGA	4	1066	1077	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	99878741
3	NC_008047	ATT	7	1387	1407	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	99878741
4	NC_008047	AATT	3	1447	1459	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	99878741
5	NC_008047	TATTTT	3	1854	1871	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	99878742
6	NC_008047	TTA	4	2274	2285	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	99878742
7	NC_008047	TTAG	3	3044	3054	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	99878743
8	NC_008047	TTAA	3	3364	3374	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008047	TAA	4	3464	3475	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878744
10	NC_008047	GATT	3	4220	4230	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_008047	TTTAAA	3	4464	4482	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_008047	TTA	4	4898	4909	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	99878745
13	NC_008047	TAA	4	5147	5158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878746
14	NC_008047	TAA	4	6127	6138	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878746
15	NC_008047	AATT	3	6413	6423	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	99878746
16	NC_008047	TATT	3	6480	6490	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	99878746
17	NC_008047	TTTA	3	6498	6510	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	99878746
18	NC_008047	ATTA	3	6527	6537	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	99878746
19	NC_008047	TAA	4	6547	6558	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878746
20	NC_008047	TTC	4	6622	6634	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_008047	AATT	3	6815	6826	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008047	TAT	4	6905	6916	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008047	AAATTT	3	6926	6943	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_008047	ATTAA	3	7122	7136	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_008047	TAT	4	7357	7368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008047	TTA	4	7499	7510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_008047	TTA	4	7853	7864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008047	TAAA	3	7870	7881	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008047	AATA	3	8365	8376	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_008047	ATTA	3	8389	8399	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008047	TAT	7	8760	8780	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	99878747
32	NC_008047	ATT	4	8944	8955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	99878747
33	NC_008047	ATT	4	8987	8997	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	99878747
34	NC_008047	TTAT	3	9004	9015	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	99878747
35	NC_008047	TATG	3	9075	9087	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_008047	TAA	5	9451	9465	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	99878752
37	NC_008047	TAT	4	9779	9790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	99878752
38	NC_008047	TAAA	3	10003	10013	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	99878752
39	NC_008047	TAT	4	11127	11138	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_008047	GAT	4	11235	11246	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	99878749
41	NC_008047	TAA	4	11517	11528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878749
42	NC_008047	TTTTA	4	11552	11570	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	99878749
43	NC_008047	AAT	4	12169	12180	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878750
44	NC_008047	TTTA	3	12302	12313	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	99878750
45	NC_008047	TAA	4	12435	12446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	99878750
46	NC_008047	TTGT	3	12650	12662	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	99878750
47	NC_008047	CTTTT	3	12936	12949	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	99878750
48	NC_008047	TAT	4	13664	13674	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	99878751
49	NC_008047	TTTA	3	13993	14004	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	99878751
50	NC_008047	AAT	4	14740	14751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_008047	TAA	4	15758	15769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_008047	AATT	3	16044	16054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_008047	TATT	3	16111	16121	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008047	TTTA	3	16129	16141	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_008047	ATTA	3	16158	16168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008047	TAA	4	16178	16189	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008047	TTC	4	16253	16265	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
58	NC_008047	AATT	3	16446	16457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008047	TAT	4	16536	16547	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_008047	AAATTT	3	16557	16574	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_008047	ATTAA	3	16753	16767	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_008047	TAT	4	16988	16999	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_008047	TTA	4	17130	17141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_008047	TTA	4	17484	17495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_008047	TAAA	3	17501	17512	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_008047	AATA	3	17996	18007	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Strelkovimermis spiculatus mitochondrion