ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007982	AG	7	104	116	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_007982	AG	7	2838	2850	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007982	CA	6	8716	8726	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_007982	AG	6	10593	10604	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007982	CT	6	13510	13520	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_007982	TC	6	15289	15299	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_007982	GA	6	23324	23335	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007982	GA	6	27952	27962	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_007982	CT	7	28064	28077	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
10	NC_007982	GA	7	42331	42344	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_007982	AG	6	44420	44430	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_007982	TA	6	60294	60304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
13	NC_007982	TA	7	66017	66029	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502719
14	NC_007982	TG	6	80816	80826	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	94502719
15	NC_007982	TA	6	82856	82866	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502719
16	NC_007982	TA	11	92591	92613	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94502719
17	NC_007982	CT	6	96174	96184	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502719
18	NC_007982	CT	6	98832	98842	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502719
19	NC_007982	CT	7	112502	112515	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	94502719
20	NC_007982	AG	6	112533	112544	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	94502719
21	NC_007982	TC	6	128592	128602	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502719
22	NC_007982	AT	6	131831	131841	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502719
23	NC_007982	AT	7	142826	142838	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502719
24	NC_007982	TC	6	143333	143343	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502719
25	NC_007982	TA	6	149094	149104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502719
26	NC_007982	TC	6	153694	153704	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502719
27	NC_007982	TA	7	166637	166649	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
28	NC_007982	AT	6	177524	177534	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
29	NC_007982	GA	6	181481	181491	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	94502722
30	NC_007982	CT	6	191914	191924	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502722
31	NC_007982	AG	6	192875	192886	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	94502722
32	NC_007982	CT	6	209578	209588	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502722
33	NC_007982	TC	6	212196	212207	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	94502722
34	NC_007982	TA	7	223680	223692	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
35	NC_007982	TC	6	227771	227782	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	94502722
36	NC_007982	AT	7	228182	228195	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
37	NC_007982	AG	7	246348	246360	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	94502722
38	NC_007982	CT	6	257479	257490	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	94502722
39	NC_007982	CT	6	257501	257512	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	94502722
40	NC_007982	AT	7	258955	258968	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
41	NC_007982	TC	6	280558	280568	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502722
42	NC_007982	TC	6	286361	286372	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	94502722
43	NC_007982	TA	6	294634	294645	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94502722
44	NC_007982	TG	8	295142	295157	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	94502722
45	NC_007982	CT	6	305446	305456	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502722
46	NC_007982	GA	6	315880	315891	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	94502722
47	NC_007982	AT	9	324913	324929	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	94502722
48	NC_007982	TA	6	325615	325626	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94502722
49	NC_007982	TA	7	330749	330762	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
50	NC_007982	GA	6	338771	338781	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	94502722
51	NC_007982	AT	6	360110	360120	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
52	NC_007982	AT	6	360227	360237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
53	NC_007982	AT	7	361786	361798	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
54	NC_007982	TA	6	365675	365685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
55	NC_007982	TA	7	370397	370410	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
56	NC_007982	GA	6	376103	376115	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	94502722
57	NC_007982	AG	7	384593	384606	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	94502722
58	NC_007982	TA	7	386987	387000	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
59	NC_007982	TC	6	387992	388002	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	94502722
60	NC_007982	AG	6	402386	402396	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	94502722
61	NC_007982	TG	6	405257	405267	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	94502722
62	NC_007982	TC	7	412248	412261	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	94502722
63	NC_007982	AT	7	425869	425882	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
64	NC_007982	TA	7	430079	430092	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94502722
65	NC_007982	AT	6	431284	431295	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94502722
66	NC_007982	AG	7	437140	437153	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	94502722
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70	NC_007982	AT	6	491550	491560	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94502722
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81	NC_007982	GA	6	564533	564543	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	94502602

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