Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Helianthus annuus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007977TAC4195019621333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
2NC_007977TTC421732184120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502472
3NC_007977TAA4739974101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_007977AAT411127111371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_007977AAG412582125941366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
6NC_007977GGA417681176921233.33 %0 %66.67 %0 %8 %270039756
7NC_007977GAA417728177381166.67 %0 %33.33 %0 %9 %270039756
8NC_007977GTT52513425148150 %66.67 %33.33 %0 %6 %94502482
9NC_007977TAA527788278031666.67 %33.33 %0 %0 %6 %94502484
10NC_007977TGT42862428635120 %66.67 %33.33 %0 %8 %94502485
11NC_007977TAA432277322891366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_007977GAG434077340871133.33 %0 %66.67 %0 %9 %94502487
13NC_007977TTC43480734818120 %66.67 %0 %33.33 %0 %94502487
14NC_007977CTT43594135952120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
15NC_007977ATG438419384291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502490
16NC_007977GCA440317403281233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %94502491
17NC_007977AGA444798448091266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
18NC_007977TTA450847508581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_007977TTC45130751317110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
20NC_007977TAG453763537741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %94502498
21NC_007977ATA453791538011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_007977TTG45450754517110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
23NC_007977ATT456355563671333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_007977TAA458587585991366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_007977ATA458680586911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_007977ATA459963599731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
27NC_007977TTC46238662397120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502504
28NC_007977ATA466244662551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_007977TCT47316073171120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502470
30NC_007977CTG47820078212130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %94502470
31NC_007977ATA478269782801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %94502470
32NC_007977TAT483317833291333.33 %66.67 %0 %0 %7 %94502470
33NC_007977GAT485577855871133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502470
34NC_007977TTA495595956061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %94502470
35NC_007977TTC49743297443120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502551
36NC_007977GAA51077381077521566.67 %0 %33.33 %0 %6 %94502551
37NC_007977GAA51083531083671566.67 %0 %33.33 %0 %0 %94502551
38NC_007977GAA41083801083911266.67 %0 %33.33 %0 %0 %94502551
39NC_007977GAA41084041084151266.67 %0 %33.33 %0 %0 %94502551
40NC_007977GAA41085001085101166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502551
41NC_007977GAA41089781089901366.67 %0 %33.33 %0 %7 %94502551
42NC_007977AGA41104341104441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %94502551
43NC_007977CTT4115258115268110 %66.67 %0 %33.33 %9 %94502551
44NC_007977AGA51164581164721566.67 %0 %33.33 %0 %6 %94502551
45NC_007977AGT41211011211111133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %94502551
46NC_007977CTT4124245124256120 %66.67 %0 %33.33 %8 %94502551
47NC_007977GAA41371921372031266.67 %0 %33.33 %0 %8 %94502551
48NC_007977TAA41390291390401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding