ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Coreana raphaelis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007976	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_007976	TTTTTA	3	250	268	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	94490711
3	NC_007976	TAA	4	400	411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490711
4	NC_007976	TAT	5	701	714	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	94490711
5	NC_007976	AATT	3	793	803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94490711
6	NC_007976	ATT	4	1034	1046	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	94490711
7	NC_007976	ATTT	6	1062	1085	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	94490711
8	NC_007976	TAT	4	1955	1966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490712
9	NC_007976	AATT	3	1970	1980	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94490712
10	NC_007976	TAT	6	2030	2046	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	94490712
11	NC_007976	GAAA	3	2242	2253	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	94490712
12	NC_007976	ATTT	3	2487	2498	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	94490712
13	NC_007976	TAT	4	2696	2706	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	94490712
14	NC_007976	ATA	4	2853	2864	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490712
15	NC_007976	ATA	4	3486	3498	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	94490713
16	NC_007976	AATT	3	3716	3726	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94490713
17	NC_007976	ATTTA	3	3800	3814	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007976	TTTC	3	3915	3925	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	94490714
19	NC_007976	TTTTTA	3	3927	3944	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	94490714
20	NC_007976	AATTTT	3	4620	4637	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	94490715
21	NC_007976	ATC	4	4723	4734	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	94490716
22	NC_007976	TAATTT	3	4823	4840	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	94490716
23	NC_007976	ATT	4	4860	4870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	94490716
24	NC_007976	TTG	4	5446	5457	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	94490716
25	NC_007976	TTTAA	3	5559	5573	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_007976	ATT	7	5582	5600	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	94490717
27	NC_007976	TAT	4	5611	5624	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	94490717
28	NC_007976	TAT	6	5629	5645	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	94490717
29	NC_007976	TAT	4	5866	5877	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490717
30	NC_007976	AATT	5	5917	5937	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	94490717
31	NC_007976	TAA	4	6332	6343	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_007976	TAAA	3	6473	6484	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	94490718
33	NC_007976	ATA	4	6504	6515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490718
34	NC_007976	AATT	3	6828	6839	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94490718
35	NC_007976	TTA	4	6863	6874	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490718
36	NC_007976	ATT	4	6877	6888	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490718
37	NC_007976	TTA	4	7040	7051	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490718
38	NC_007976	TTA	4	7298	7309	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490718
39	NC_007976	ATA	5	7403	7417	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	94490718
40	NC_007976	AAT	4	7587	7598	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490718
41	NC_007976	TAA	4	7841	7853	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	94490718
42	NC_007976	ATT	5	8056	8069	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	94490718
43	NC_007976	ATTAAT	4	8407	8430	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94490719
44	NC_007976	TAT	4	9074	9086	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	94490719
45	NC_007976	AAAT	3	9132	9142	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	94490719
46	NC_007976	AAAAT	3	9221	9234	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	94490719
47	NC_007976	TAA	4	9276	9287	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490719
48	NC_007976	AT	7	9679	9691	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	94490720
49	NC_007976	ATT	4	9696	9707	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	94490720
50	NC_007976	ATTATA	4	9819	9842	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	94490720
51	NC_007976	ATT	5	9970	9984	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_007976	TATTT	5	10265	10289	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	94490721
53	NC_007976	ATA	4	10385	10396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490721
54	NC_007976	TAA	7	10430	10450	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	94490721
55	NC_007976	TTTA	4	10447	10462	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	94490721
56	NC_007976	T	14	10802	10815	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	94490722
57	NC_007976	ATT	4	10890	10900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	94490722
58	NC_007976	ATTT	3	11125	11135	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	94490722
59	NC_007976	ATT	7	11235	11254	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	94490722
60	NC_007976	ATA	4	11784	11796	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	94490723
61	NC_007976	AATAT	3	12137	12150	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	94490723
62	NC_007976	TTA	4	12183	12193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	94490723
63	NC_007976	TAA	4	12283	12295	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	94490723
64	NC_007976	TAAAA	3	12355	12368	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	94490723
65	NC_007976	TTAT	3	12492	12503	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	94490723
66	NC_007976	AAT	4	12661	12672	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	94490723
67	NC_007976	TA	6	12701	12711	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_007976	TTTA	3	12839	12850	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007976	T	14	12979	12992	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_007976	TTTATT	3	13482	13499	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_007976	ATTA	3	13847	13858	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007976	TAAT	4	14077	14092	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_007976	TTAAA	3	14098	14111	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_007976	ATT	4	14304	14314	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_007976	AATTT	3	14703	14716	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_007976	TTAT	4	14785	14800	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_007976	ATT	4	14849	14860	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007976	ATTT	3	14931	14941	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_007976	T	24	14966	14989	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_007976	ATTA	4	15135	15150	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_007976	AT	11	15174	15194	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_007976	AT	9	15209	15226	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_007976	AT	6	15229	15240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_007976	AT	8	15245	15259	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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