ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007957	AAC	4	178	188	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007957	CAG	5	1005	1019	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	91983972
3	NC_007957	ATA	4	6681	6692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007957	TAT	4	6761	6773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007957	CAA	4	9841	9852	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007957	TTA	4	9916	9926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_007957	TTA	4	18100	18111	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007957	GTT	4	25302	25313	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	91983983
9	NC_007957	ATT	4	28604	28615	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007957	GGA	4	37767	37778	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	91983988
11	NC_007957	TAT	7	39682	39702	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_007957	TTA	4	39879	39891	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_007957	TAT	4	39924	39934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_007957	ATA	4	40992	41003	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91983991
15	NC_007957	ATG	4	42376	42386	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91983991
16	NC_007957	GCA	4	44274	44285	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	91983992
17	NC_007957	TAG	4	45922	45933	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_007957	GTA	4	48348	48358	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_007957	ATG	4	52035	52046	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_007957	TTA	4	55097	55109	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_007957	ATA	6	58655	58671	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	91983999
22	NC_007957	TAT	4	59142	59154	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_007957	TGT	5	59386	59399	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_007957	ATT	4	63014	63024	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_007957	GAA	4	63506	63516	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_007957	TTA	4	64120	64130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_007957	CTT	4	66072	66083	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984004
28	NC_007957	TTA	4	68498	68509	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_007957	TAT	4	68849	68861	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_007957	AGT	4	69938	69950	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_007957	TAT	4	71663	71675	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_007957	ATA	4	71682	71693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_007957	GAA	4	73326	73337	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007957	TCT	4	78743	78754	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
35	NC_007957	ACA	4	78890	78900	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	91984052
36	NC_007957	ATA	4	86730	86742	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	91984052
37	NC_007957	TTA	4	87672	87682	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91984052
38	NC_007957	TCT	4	88799	88810	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
39	NC_007957	CTT	4	89308	89319	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
40	NC_007957	GAT	4	89776	89786	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91984052
41	NC_007957	GAT	4	91147	91157	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91984052
42	NC_007957	GAT	4	94201	94212	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	91984052
43	NC_007957	TGA	4	95931	95942	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	91984052
44	NC_007957	TTC	4	104158	104169	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
45	NC_007957	GAA	5	114528	114542	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	91984052
46	NC_007957	AAG	4	115438	115449	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91984052
47	NC_007957	TAA	4	116184	116195	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91984052
48	NC_007957	ATT	4	117121	117132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91984052
49	NC_007957	TTG	4	117684	117695	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	91984052
50	NC_007957	TAT	5	118849	118863	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91984052
51	NC_007957	CTT	4	121126	121136	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	91984052
52	NC_007957	CTA	4	122416	122427	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
53	NC_007957	TTC	5	126294	126308	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	91984052
54	NC_007957	ATA	5	126669	126684	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	91984052
55	NC_007957	ATA	4	129759	129769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91984052
56	NC_007957	TAT	4	129785	129796	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91984052
57	NC_007957	TCT	4	134610	134621	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91984052
58	NC_007957	TTC	6	135514	135532	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	91984052
59	NC_007957	GAA	4	145891	145902	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91984052
60	NC_007957	ATC	4	155848	155859	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	91984056
61	NC_007957	ATC	4	158903	158913	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_007957	ATC	4	160274	160284	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_007957	GAA	5	160740	160754	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_007957	GTA	4	160794	160806	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera chloroplast