ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Physcomitrella patens mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007945	CTT	4	1288	1299	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_007945	CTC	4	7799	7810	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	17125915
3	NC_007945	TAA	4	14123	14134	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91208844
4	NC_007945	ATT	4	15494	15504	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_007945	TTA	4	15757	15768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91208846
6	NC_007945	CAA	4	16225	16235	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	91208846
7	NC_007945	ATT	4	21634	21645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007945	TAA	4	21670	21681	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007945	TAA	4	21726	21737	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007945	CAT	4	27802	27812	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	17125915
11	NC_007945	ATG	4	30950	30961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_007945	GCG	4	34693	34703	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_007945	TAA	4	37867	37878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007945	ATA	4	40057	40068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_007945	ATA	4	46491	46501	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	17125916
16	NC_007945	AGA	4	46514	46524	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	17125916
17	NC_007945	GAT	4	48067	48077	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	17125916
18	NC_007945	GAA	4	48929	48939	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_007945	CAA	4	54393	54403	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_007945	CTC	4	58319	58331	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	91208861
21	NC_007945	TGC	4	61080	61092	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_007945	ATC	4	65160	65170	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	91208863
23	NC_007945	GAA	4	66227	66238	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	91208863
24	NC_007945	TCT	4	66259	66269	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	91208863
25	NC_007945	AGG	4	69812	69823	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	91208864
26	NC_007945	TTA	4	73206	73217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	91208865
27	NC_007945	TAC	4	82789	82800	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	91208868
28	NC_007945	CTT	4	84941	84952	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91208869
29	NC_007945	CGA	4	89760	89770	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	91208870
30	NC_007945	ATT	4	94126	94137	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91208873
31	NC_007945	TTA	4	95279	95290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91208873
32	NC_007945	TAT	4	96243	96253	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_007945	GAA	4	96590	96600	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_007945	ATA	4	97005	97016	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91208875
35	NC_007945	ACT	4	103225	103235	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	91208880

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Physcomitrella patens mitochondrion