Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Gossypium hirsutum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007944ATT5488749011533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
2NC_007944TGT449544964110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
3NC_007944GTT450515061110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
4NC_007944TAA4667766881266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_007944AAT4669567061266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_007944AAT413578135891266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
7NC_007944TTA417246172571233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_007944ATG718293183132133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91208892
9NC_007944TAA423994240041166.67 %33.33 %0 %0 %9 %91208893
10NC_007944GTT42442624437120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91208893
11NC_007944GAA427877278881266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
12NC_007944TAT428558285681133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_007944TTA437206372171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_007944ATA538329383441666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
15NC_007944TAA438413384231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_007944ATA444906449181366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
17NC_007944TAG446579465891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91208903
18NC_007944AAT448464484741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_007944AAT448486484971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_007944TAA449687496991366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_007944ATT550379503921433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_007944TTA453406534171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_007944CAA453911539211166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
24NC_007944ATT562520625341533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_007944CTT46560465615120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91208914
26NC_007944AAT467560675711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_007944ATA467677676871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_007944TCT46921369225130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
29NC_007944ATA572122721351466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_007944CTT47817278182110 %66.67 %0 %33.33 %9 %91208947
31NC_007944ATA488517885281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91208947
32NC_007944CTT48891588926120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91208947
33NC_007944GAT489387893971133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91208947
34NC_007944GAT490779907891133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91208947
35NC_007944AGA494498945081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %91208947
36NC_007944TTC4103791103802120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91208960
37NC_007944GAA51144801144941566.67 %0 %33.33 %0 %6 %91208960
38NC_007944AAG41190861190971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %91208960
39NC_007944AAT41193241193361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %91208960
40NC_007944TAA41199361199471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91208960
41NC_007944CAA41300851300951166.67 %0 %0 %33.33 %9 %91208960
42NC_007944TAT41307341307461333.33 %66.67 %0 %0 %7 %91208960
43NC_007944TAA51320141320291666.67 %33.33 %0 %0 %6 %91208960
44NC_007944GTT4133379133390120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91208960
45NC_007944ATT41346101346211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %91208960
46NC_007944AAT41346411346541466.67 %33.33 %0 %0 %7 %91208960
47NC_007944GAA41452951453061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %91208960
48NC_007944ACC41537891537991133.33 %0 %0 %66.67 %9 %91208964
49NC_007944TTC4154588154598110 %66.67 %0 %33.33 %9 %91208964
50NC_007944ATC41583081583181133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
51NC_007944ATC41597001597101133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %91208966
52NC_007944GAA51601701601841566.67 %0 %33.33 %0 %6 %91208966