ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Solanum bulbocastanum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007943	TAT	4	170	181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_007943	TTA	4	2016	2027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_007943	AAG	5	2979	2993	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	91208969
4	NC_007943	GAA	4	4366	4377	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007943	TTA	4	9919	9930	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007943	ATT	4	23902	23914	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91208979
7	NC_007943	CAG	4	28582	28593	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007943	TTA	4	28752	28762	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_007943	TTA	4	29105	29116	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007943	TAG	4	32113	32124	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007943	ATT	4	32226	32236	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_007943	TTC	4	35921	35932	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91208984
13	NC_007943	TAG	4	44970	44980	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91208989
14	NC_007943	GTA	4	45557	45567	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_007943	AAT	4	46398	46409	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_007943	TAT	4	52197	52207	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_007943	AGA	4	52273	52284	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_007943	TTA	4	52834	52845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007943	ATA	4	55803	55816	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	91208995
20	NC_007943	TTG	4	56572	56582	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_007943	TTA	5	58449	58464	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_007943	TAA	4	58629	58639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_007943	TTA	4	60773	60784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_007943	GTT	4	66983	66993	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_007943	TCT	4	75636	75647	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91209035
26	NC_007943	AGA	4	78669	78679	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	91209035
27	NC_007943	TTA	4	85566	85577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91209035
28	NC_007943	CTT	4	85973	85984	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91209035
29	NC_007943	GAT	4	86440	86450	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91209035
30	NC_007943	GAT	4	87814	87824	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	91209035
31	NC_007943	TGA	4	92568	92579	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	91209035
32	NC_007943	TTC	4	100313	100324	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91209048
33	NC_007943	AAT	4	111303	111314	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91209048
34	NC_007943	ATT	4	112116	112128	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91209048
35	NC_007943	TAA	4	112530	112541	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91209048
36	NC_007943	AAG	4	112755	112766	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91209048
37	NC_007943	ATA	4	120253	120265	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	91209048
38	NC_007943	TTC	5	121375	121389	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	91209048
39	NC_007943	TTA	4	129815	129826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91209048
40	NC_007943	GAA	4	140804	140815	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91209048
41	NC_007943	ATC	4	153304	153314	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
42	NC_007943	ATC	4	154678	154688	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	91209054
43	NC_007943	GAA	5	155143	155157	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	91209054

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Solanum bulbocastanum chloroplast