Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Glycine max chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007942TCT521212134140 %66.67 %0 %33.33 %7 %91214124
2NC_007942ATA4298029911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91214124
3NC_007942ATA410495105061266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_007942ATA410619106301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_007942ATT514613146271533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
6NC_007942AAT414646146571266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_007942CTT41509415104110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
8NC_007942AAT415802158141366.67 %33.33 %0 %0 %7 %91214131
9NC_007942TAT423469234791133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_007942AGA423600236101166.67 %0 %33.33 %0 %9 %91214135
11NC_007942TAT424521245331333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_007942ATT428603286151333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_007942ATT828626286492433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_007942ATA429629296401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_007942ATA433905339161266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_007942AAC437505375161266.67 %0 %0 %33.33 %8 %91214142
17NC_007942GAA439009390211366.67 %0 %33.33 %0 %7 %91214142
18NC_007942CAT440821408321233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %91214143
19NC_007942TAA545712457251466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_007942AAT445920459311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_007942GTT54657146585150 %66.67 %33.33 %0 %6 %91214145
22NC_007942TAA447144471541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_007942TAT447675476861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_007942CTG44783447845120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %91214146
25NC_007942TGT45008050091120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91214148
26NC_007942GAT453856538661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
27NC_007942TAT456834568441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_007942ATG457119571301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %91214152
29NC_007942ATT459385593951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_007942TTC46147161482120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91214155
31NC_007942TTG46366863679120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
32NC_007942CTG46855868569120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %91214186
33NC_007942TAT469427694391333.33 %66.67 %0 %0 %7 %91214186
34NC_007942TCT46970469714110 %66.67 %0 %33.33 %9 %91214186
35NC_007942AAT470604706141166.67 %33.33 %0 %0 %9 %91214186
36NC_007942AAT473941739521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91214186
37NC_007942CAA479954799651266.67 %0 %0 %33.33 %8 %91214186
38NC_007942ATA480740807501166.67 %33.33 %0 %0 %9 %91214186
39NC_007942ACG483307833181233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %91214186
40NC_007942CTT48335083361120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91214186
41NC_007942GAT483818838281133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91214186
42NC_007942GAT485244852541133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91214186
43NC_007942TTA498728987391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %91214200
44NC_007942AAT41097601097711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91214200
45NC_007942GAA41099371099481266.67 %0 %33.33 %0 %8 %91214200
46NC_007942AGA41115391115491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %91214200
47NC_007942GTT4116519116530120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91214200
48NC_007942TAA41194161194261166.67 %33.33 %0 %0 %9 %91214200
49NC_007942TTC4119592119603120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91214200
50NC_007942TTA41200961201081333.33 %66.67 %0 %0 %7 %91214200
51NC_007942AAT41242481242601366.67 %33.33 %0 %0 %7 %91214200
52NC_007942TAA41366551366661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91214200
53NC_007942ACC41453311453411133.33 %0 %0 %66.67 %9 %91214203
54NC_007942ATC41501401501501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
55NC_007942ATC41515661515761133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %91214205
56NC_007942GAA51520321520461566.67 %0 %33.33 %0 %6 %91214205