ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007935	ATTA	3	764	775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_007935	TTTA	5	1069	1087	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
3	NC_007935	ATTT	3	1356	1367	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007935	TGAT	6	1576	1599	24	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007935	TTAA	3	1624	1634	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_007935	AATT	6	1716	1739	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007935	TAAA	4	2274	2289	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007935	ATTA	3	2325	2336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007935	TATC	8	2433	2464	32	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007935	TTAA	3	2528	2540	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_007935	TTTA	14	2622	2677	56	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_007935	TAAA	4	3890	3905	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_007935	TAAA	3	4059	4070	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007935	TTTA	3	4735	4746	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_007935	TTTA	3	5425	5435	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
16	NC_007935	TATT	6	6305	6327	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
17	NC_007935	TATT	3	7034	7044	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
18	NC_007935	ATAA	10	8197	8235	39	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	91176247
19	NC_007935	ATCT	3	8316	8327	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
20	NC_007935	ACTT	3	8615	8625	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
21	NC_007935	GATT	3	10562	10572	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	91176247
22	NC_007935	ATAA	5	13236	13255	20	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	91176247
23	NC_007935	ATTT	3	13319	13329	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
24	NC_007935	TTCC	3	13865	13876	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	91176247
25	NC_007935	TTCC	3	13900	13912	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	91176247
26	NC_007935	TTCC	3	13940	13952	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	91176247
27	NC_007935	TTAA	3	14418	14429	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
28	NC_007935	ATCG	8	15004	15035	32	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	91176247
29	NC_007935	TTTA	3	15284	15295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
30	NC_007935	TTTA	3	15321	15333	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	91176247
31	NC_007935	CCCT	3	15575	15586	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	91176247
32	NC_007935	TACT	3	15598	15608	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
33	NC_007935	AATT	3	16143	16154	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
34	NC_007935	TTTC	3	19107	19117	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	91176247
35	NC_007935	TTAT	3	19931	19943	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	91176247
36	NC_007935	TTTA	3	20555	20566	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
37	NC_007935	AAAT	3	21046	21057	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	91176247
38	NC_007935	CTTA	3	21161	21172	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
39	NC_007935	TTAC	8	21370	21401	32	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
40	NC_007935	TACT	3	21591	21602	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
41	NC_007935	TCCT	3	21671	21682	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	91176247
42	NC_007935	GATC	3	21958	21969	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	91176247
43	NC_007935	TCCT	37	22285	22433	149	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	91176247
44	NC_007935	TATT	3	22858	22870	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	91176247
45	NC_007935	CCTT	3	23921	23931	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	91176247
46	NC_007935	TTTA	4	24098	24113	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91176247
47	NC_007935	TCGA	4	24122	24137	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	91176247
48	NC_007935	TATT	3	24142	24157	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91176247
49	NC_007935	TAAT	3	24590	24601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	91176247
50	NC_007935	TTAA	3	25887	25899	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	91176247
51	NC_007935	AATT	6	27126	27149	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
52	NC_007935	TATT	3	27409	27420	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91176247
53	NC_007935	TTAT	3	28024	28035	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
54	NC_007935	TTAT	4	29018	29032	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	91176247
55	NC_007935	TTCA	3	29345	29356	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
56	NC_007935	TTAT	4	30668	30683	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	91176247
57	NC_007935	ATTA	9	30706	30742	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
58	NC_007935	ATAA	3	32623	32634	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	91176247
59	NC_007935	TAAA	16	32820	32883	64	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	91176247
60	NC_007935	TTTA	3	32923	32934	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
61	NC_007935	TAAA	5	33091	33112	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	91176247
62	NC_007935	TATT	3	33208	33219	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
63	NC_007935	AGAT	3	33431	33441	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	91176247
64	NC_007935	AAAT	3	33554	33564	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	91176247
65	NC_007935	AGGA	3	35246	35256	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	91176247
66	NC_007935	TAAT	3	35912	35924	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	91176247
67	NC_007935	TATT	3	37751	37762	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
68	NC_007935	ACTC	6	40070	40093	24	25 %	25 %	0 %	50 %	4 %	91176247
69	NC_007935	TATT	5	40922	40942	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
70	NC_007935	TCAA	3	41848	41858	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	91176247
71	NC_007935	ATTC	3	42053	42063	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
72	NC_007935	AGAT	3	42417	42427	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	91176247
73	NC_007935	AATT	3	42658	42669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
74	NC_007935	ATTT	3	43539	43550	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91176247
75	NC_007935	ACTT	3	44201	44211	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
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77	NC_007935	ATAA	8	44843	44875	33	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	91176247
78	NC_007935	ATTA	3	46018	46028	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
79	NC_007935	ATTA	7	48059	48086	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	91176247
80	NC_007935	ATAA	5	48131	48150	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	91176247
81	NC_007935	AAAT	3	50478	50489	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	91176247
82	NC_007935	AAAT	3	51845	51857	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	91176247
83	NC_007935	TTAT	6	52256	52279	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
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86	NC_007935	TACT	16	54264	54328	65	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
87	NC_007935	ATTA	6	54407	54430	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
88	NC_007935	TTTA	4	54435	54450	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	91176247
89	NC_007935	ATCG	3	54649	54660	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	91176247
90	NC_007935	ATTT	7	54746	54777	32	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
91	NC_007935	AAGA	3	55102	55114	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	91176247
92	NC_007935	TAAT	8	56124	56155	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
93	NC_007935	TAAG	5	56173	56191	19	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	91176247
94	NC_007935	AAAT	4	56821	56836	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	91176247
95	NC_007935	TTAA	3	57657	57668	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
96	NC_007935	AGAT	3	57756	57767	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	91176247
97	NC_007935	ATAA	3	57812	57823	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	91176247
98	NC_007935	TTAA	3	58053	58064	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	91176247
99	NC_007935	GATA	3	58117	58128	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	91176247
100	NC_007935	ATAG	8	58219	58250	32	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	91176247
101	NC_007935	CGAT	4	58593	58608	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	91176247
102	NC_007935	TAAA	7	59019	59046	28	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	91176247
103	NC_007935	GAAT	3	59568	59578	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	91176247
104	NC_007935	TCGA	3	59786	59797	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	91176247
105	NC_007935	TCCT	8	60176	60206	31	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	91176247
106	NC_007935	TAAA	3	60459	60469	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	91176247
107	NC_007935	AGTA	3	60691	60702	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	91176247
108	NC_007935	AATT	3	61601	61612	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
109	NC_007935	TTAA	8	61675	61706	32	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91176247
110	NC_007935	AATA	3	63989	64000	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	91176247
111	NC_007935	TTTA	9	64192	64226	35	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
112	NC_007935	TATT	8	64343	64374	32	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	91176247
113	NC_007935	TATT	4	64917	64932	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	91176247
114	NC_007935	TTTA	13	65855	65906	52	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
115	NC_007935	TCGA	3	66090	66101	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	91176247
116	NC_007935	AATC	8	66249	66280	32	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	91176247
117	NC_007935	TTAT	3	67465	67476	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
118	NC_007935	CGAT	4	67489	67504	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	91176247
119	NC_007935	TTTA	3	67561	67571	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
120	NC_007935	TATC	9	69874	69909	36	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
121	NC_007935	CTAT	5	69913	69932	20	25 %	50 %	0 %	25 %	10 %	91176247
122	NC_007935	ATTT	5	70042	70061	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	91176247
123	NC_007935	ATTA	3	70699	70710	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	91176247
124	NC_007935	ATAA	3	70726	70737	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	91176247

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion