ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007935	TTA	5	224	238	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_007935	TAA	9	569	595	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007935	TAA	4	629	639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_007935	GAG	8	646	669	24	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007935	GAG	8	667	690	24	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007935	ATT	4	1102	1116	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_007935	TAT	4	1196	1208	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_007935	TTA	4	1449	1460	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007935	ATT	7	1463	1483	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007935	AAG	4	1486	1497	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007935	AAT	5	1507	1521	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_007935	ATA	4	2146	2158	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_007935	TAA	4	2163	2175	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_007935	AAT	5	2178	2191	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_007935	ATA	4	2196	2207	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007935	TAA	4	2212	2224	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_007935	TAT	4	2558	2570	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_007935	TTA	4	2687	2698	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007935	ATT	6	2752	2769	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_007935	TAT	4	2817	2828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_007935	TAA	4	2992	3006	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_007935	TTA	4	3266	3276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_007935	TAT	4	3290	3301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_007935	TCT	4	3299	3310	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007935	ATT	5	3387	3401	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_007935	ATA	4	3409	3423	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_007935	TAT	7	3426	3446	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_007935	TTA	11	3652	3684	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_007935	ATA	6	3841	3859	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
30	NC_007935	ATA	5	4453	4467	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_007935	TAT	4	4610	4621	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_007935	TAA	5	4642	4656	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_007935	ATT	4	5207	5218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
34	NC_007935	TTC	4	7165	7176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
35	NC_007935	TAT	4	7360	7370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
36	NC_007935	TAT	4	7506	7517	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
37	NC_007935	TAT	4	8659	8670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
38	NC_007935	TTA	4	8688	8699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
39	NC_007935	TAT	9	9224	9249	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
40	NC_007935	TTA	5	9269	9283	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
41	NC_007935	TAT	4	9356	9368	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
42	NC_007935	ATA	6	9420	9436	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	91176247
43	NC_007935	TTA	9	9483	9509	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
44	NC_007935	ATT	8	9506	9529	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
45	NC_007935	ATT	4	9605	9615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
46	NC_007935	GAA	4	10835	10846	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91176247
47	NC_007935	TGT	4	12117	12129	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	91176247
48	NC_007935	TAA	5	13647	13661	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	91176247
49	NC_007935	TTC	5	14085	14099	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	91176247
50	NC_007935	TTA	4	14106	14119	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
51	NC_007935	TTC	4	14127	14138	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
52	NC_007935	ATT	14	14144	14185	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
53	NC_007935	AGT	15	14180	14224	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	91176247
54	NC_007935	TTA	5	14273	14287	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
55	NC_007935	ATA	5	14323	14337	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	91176247
56	NC_007935	ATA	4	14779	14789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91176247
57	NC_007935	TAA	4	15106	15116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91176247
58	NC_007935	TTA	4	15121	15132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
59	NC_007935	TAT	4	15301	15312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
60	NC_007935	TAT	5	15720	15734	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
61	NC_007935	TAT	4	15756	15767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
62	NC_007935	TTA	7	15767	15787	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
63	NC_007935	TTA	5	15791	15805	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
64	NC_007935	ATT	5	15835	15849	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
65	NC_007935	ATT	4	15856	15867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
66	NC_007935	TAT	14	15878	15920	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
67	NC_007935	TCT	4	15918	15929	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
68	NC_007935	TAT	4	15930	15941	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
69	NC_007935	ATT	7	15949	15969	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
70	NC_007935	ATT	4	16129	16140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
71	NC_007935	TTA	7	17099	17119	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
72	NC_007935	TTA	4	17130	17141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
73	NC_007935	CTA	4	17193	17203	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	91176247
74	NC_007935	TAT	4	17525	17535	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
75	NC_007935	TCC	5	17546	17560	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	91176247
76	NC_007935	CTC	8	17557	17580	24	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
77	NC_007935	TCC	4	17582	17593	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
78	NC_007935	TCC	25	17597	17668	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	91176247
79	NC_007935	CTC	8	17669	17692	24	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
80	NC_007935	ATA	4	18498	18509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91176247
81	NC_007935	CTT	4	18827	18837	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	91176247
82	NC_007935	ATA	4	19429	19440	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	91176247
83	NC_007935	TAT	4	19451	19462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
84	NC_007935	TTA	4	19551	19562	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
85	NC_007935	TCT	4	20647	20658	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
86	NC_007935	CCT	27	20835	20919	85	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	91176247
87	NC_007935	TCC	8	20843	20867	25	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
88	NC_007935	TAT	7	21815	21835	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
89	NC_007935	TTA	6	22463	22483	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
90	NC_007935	TTA	12	22524	22560	37	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
91	NC_007935	ATT	4	23005	23016	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
92	NC_007935	TAT	4	23139	23149	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
93	NC_007935	TTC	4	23446	23457	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
94	NC_007935	TTA	4	23638	23649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
95	NC_007935	TCC	4	23788	23801	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	91176247
96	NC_007935	CTC	7	23805	23825	21	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	91176247
97	NC_007935	CTC	38	23805	23918	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	91176247
98	NC_007935	CTC	5	23954	23968	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	91176247
99	NC_007935	CCT	4	23982	23993	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
100	NC_007935	CTC	4	24014	24025	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	91176247
101	NC_007935	TCT	5	24267	24281	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	91176247
102	NC_007935	TAT	4	24279	24292	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
103	NC_007935	TTA	4	24411	24422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
104	NC_007935	ATA	12	24423	24458	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91176247
105	NC_007935	TAT	4	25102	25112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
106	NC_007935	GAA	7	26000	26020	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	4 %	91176247
107	NC_007935	TAT	4	26361	26373	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
108	NC_007935	TAT	8	27966	27989	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
109	NC_007935	ATA	4	28260	28271	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91176247
110	NC_007935	ATT	4	28770	28780	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
111	NC_007935	TAT	4	29302	29313	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
112	NC_007935	CTT	4	29482	29494	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	91176247
113	NC_007935	ATC	4	29584	29595	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
114	NC_007935	TTA	6	29987	30003	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	91176247
115	NC_007935	TTA	4	30010	30021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
116	NC_007935	TCT	4	30295	30305	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	91176247
117	NC_007935	TTA	8	30856	30879	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
118	NC_007935	ATA	4	31202	31214	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	91176247
119	NC_007935	ATT	5	31474	31489	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
120	NC_007935	TTA	15	31488	31531	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
121	NC_007935	ATA	4	31876	31887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91176247
122	NC_007935	ATT	4	32111	32123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
123	NC_007935	ATA	6	32169	32185	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	91176247
124	NC_007935	AAT	4	32636	32646	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91176247
125	NC_007935	ATT	5	32645	32659	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
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127	NC_007935	ATA	5	33314	33328	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	91176247
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion