ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Octopus ocellatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007896	TAA	4	446	458	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	89337414
2	NC_007896	TTAA	3	1343	1353	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89337415
3	NC_007896	TAT	4	1568	1579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89337416
4	NC_007896	ATC	4	1598	1609	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	89337416
5	NC_007896	TAT	4	1915	1927	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	89337416
6	NC_007896	AAT	4	1974	1985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89337416
7	NC_007896	TCAA	5	2033	2052	20	50 %	25 %	0 %	25 %	10 %	89337416
8	NC_007896	TATAA	3	2820	2833	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	89337417
9	NC_007896	GAG	4	3200	3211	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	89337417
10	NC_007896	TAA	4	4211	4223	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	89337418
11	NC_007896	ATT	4	4323	4333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	89337418
12	NC_007896	TATT	3	5080	5090	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89337420
13	NC_007896	ATT	4	5151	5162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89337420
14	NC_007896	CCTTAT	3	5293	5310	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	89337420
15	NC_007896	AT	6	5841	5851	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89337421
16	NC_007896	TAAATT	3	5915	5932	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	89337421
17	NC_007896	TAA	4	6116	6126	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	89337421
18	NC_007896	TA	7	6269	6282	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89337421
19	NC_007896	AT	6	6340	6351	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89337421
20	NC_007896	AAAT	3	6949	6960	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	89337421
21	NC_007896	ATTT	3	7060	7070	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89337421
22	NC_007896	AAT	4	7176	7187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89337421
23	NC_007896	TA	6	7382	7395	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89337421
24	NC_007896	TAA	4	7421	7432	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89337421
25	NC_007896	TAAA	3	7468	7480	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_007896	TAA	4	7596	7607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89337422
27	NC_007896	TA	7	7748	7761	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89337422
28	NC_007896	ACT	4	8122	8133	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	89337422
29	NC_007896	TAA	4	8352	8364	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	89337422
30	NC_007896	ATA	4	8399	8412	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	89337422
31	NC_007896	ATA	4	8414	8424	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	89337422
32	NC_007896	AT	6	8452	8462	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89337422
33	NC_007896	A	15	8535	8549	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	89337422
34	NC_007896	ATA	4	8663	8674	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89337422
35	NC_007896	ACA	6	8976	8994	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10 %	89337423
36	NC_007896	AT	7	9127	9140	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89337423
37	NC_007896	TA	6	9315	9325	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89337424
38	NC_007896	AAAT	3	9615	9625	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	89337424
39	NC_007896	AAAT	3	9888	9898	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	89337424
40	NC_007896	AAAAC	3	9900	9913	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	89337424
41	NC_007896	AT	6	10150	10161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89337424
42	NC_007896	AT	12	10639	10661	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89337425
43	NC_007896	AT	6	10745	10755	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89337425
44	NC_007896	TAT	4	10933	10944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89337425
45	NC_007896	CAAA	3	10953	10963	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_007896	TTA	4	10994	11005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_007896	TTAA	4	11463	11478	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	89337426
48	NC_007896	AAAC	3	11714	11725	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	89337426
49	NC_007896	CAA	4	11937	11947	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	89337426
50	NC_007896	TA	6	12798	12809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_007896	TA	6	12858	12868	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_007896	TAA	4	12900	12911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_007896	ATA	4	12959	12969	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_007896	TTAA	3	13051	13061	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_007896	TAA	4	13170	13180	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_007896	TA	23	13196	13238	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_007896	TA	6	13389	13399	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_007896	TAATA	3	13407	13420	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_007896	AT	6	13521	13531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_007896	AAT	4	14074	14086	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_007896	ATCA	3	14151	14161	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_007896	TA	7	14279	14292	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_007896	ATA	4	14381	14392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_007896	TA	6	14480	14490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_007896	TAA	4	14883	14893	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_007896	TTA	5	14998	15011	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_007896	TAA	4	15055	15067	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_007896	ATT	5	15077	15090	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_007896	TTA	5	15158	15171	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_007896	TTA	5	15238	15251	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_007896	TAA	4	15295	15307	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_007896	ATT	5	15317	15330	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_007896	AT	6	15532	15543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_007896	ATTA	4	15927	15942	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Octopus ocellatus mitochondrion