ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sepia officinalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007895	TAA	4	146	157	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255285
2	NC_007895	ATA	4	481	493	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	89255285
3	NC_007895	ATTT	3	1329	1340	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	168487818
4	NC_007895	TTAATT	3	1424	1441	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	168487818
5	NC_007895	TAT	4	1667	1677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	168487818
6	NC_007895	TAA	4	1845	1856	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	168487818
7	NC_007895	CTTA	3	1947	1957	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	168487818
8	NC_007895	ATT	4	1994	2005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007895	TTAT	3	2022	2032	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007895	TTTA	4	3078	3093	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	89255287
11	NC_007895	TAT	4	3287	3298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89255287
12	NC_007895	TTTATT	3	3443	3461	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	89255287
13	NC_007895	ATT	4	3838	3848	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	89255288
14	NC_007895	TAA	4	4444	4454	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	89255289
15	NC_007895	TTA	4	4729	4740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89255290
16	NC_007895	CTCA	3	5066	5076	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	89255290
17	NC_007895	AT	6	5272	5282	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89255291
18	NC_007895	CAAA	3	5402	5413	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	89255291
19	NC_007895	ATA	4	5437	5447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	89255291
20	NC_007895	CAAA	3	5478	5488	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	89255291
21	NC_007895	AT	6	6714	6724	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_007895	ATTT	3	7125	7136	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007895	CAAT	3	7286	7297	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_007895	TAA	4	7368	7379	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007895	TAA	4	8236	8247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_007895	ATA	4	8421	8433	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_007895	AT	6	8609	8619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_007895	TA	8	8944	8959	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_007895	TA	6	8983	8993	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_007895	TA	7	9308	9320	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_007895	AT	21	9485	9526	42	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_007895	GT	8	9519	9534	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_007895	TAAA	3	10325	10336	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	89255293
34	NC_007895	TAA	4	10436	10446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	89255293
35	NC_007895	TAT	4	10976	10987	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	89255293
36	NC_007895	AT	6	11082	11092	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89255293
37	NC_007895	ATTT	3	11422	11432	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	89255293
38	NC_007895	ATTT	4	11840	11855	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_007895	AT	7	11899	11912	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89255294
40	NC_007895	AAT	4	11966	11977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255294
41	NC_007895	TAAAT	3	12045	12059	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	89255294
42	NC_007895	TA	7	12114	12127	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	89255294
43	NC_007895	ATAA	3	12244	12255	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	89255294
44	NC_007895	ATT	4	12709	12721	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	89255294
45	NC_007895	TAA	4	13171	13182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255294
46	NC_007895	ATTA	3	13270	13281	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89255295
47	NC_007895	AAT	4	13359	13370	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255295
48	NC_007895	TAA	4	13705	13716	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255296
49	NC_007895	AACAA	3	13820	13834	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	89255296
50	NC_007895	ATTAAT	3	14105	14122	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	89255296
51	NC_007895	TAA	4	14254	14265	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	89255296
52	NC_007895	AAAC	3	14282	14293	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	89255296
53	NC_007895	TAT	4	14494	14504	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	89255296
54	NC_007895	TAA	4	15314	15325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	89255297
55	NC_007895	AT	8	15604	15619	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_007895	TA	6	15644	15654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_007895	TA	7	15969	15981	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sepia officinalis mitochondrion