ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Perfect Repeats of Oryza sativa Indica Group mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Protein ID
1NC_007886GACT315556155671225 %25 %25 %25 %89280739
2NC_007886GAAA324054240651275 %0 %25 %0 %89280739
3NC_007886TAGG326758267691225 %25 %50 %0 %89280739
4NC_007886AATA331009310201275 %25 %0 %0 %89280739
5NC_007886GCTT33412134132120 %50 %25 %25 %89280739
6NC_007886GTAG337819378301225 %25 %50 %0 %89280739
7NC_007886CATC365808658191225 %25 %0 %50 %89280739
8NC_007886TACT371674716851225 %50 %0 %25 %89280739
9NC_007886ACGA376481764921250 %0 %25 %25 %89280739
10NC_007886GCCG39046290473120 %0 %50 %50 %89280739
11NC_007886CAGT391579915901225 %25 %25 %25 %89280739
12NC_007886GACT31106161106271225 %25 %25 %25 %89280739
13NC_007886GAAA31191141191251275 %0 %25 %0 %89280739
14NC_007886TAGG31218181218291225 %25 %50 %0 %89280739
15NC_007886AATA31260691260801275 %25 %0 %0 %89280739
16NC_007886GCTT3129181129192120 %50 %25 %25 %89280739
17NC_007886GTAG31328791328901225 %25 %50 %0 %89280739
18NC_007886GAGC31565631565741225 %0 %50 %25 %89280739
19NC_007886ATAG31592281592391250 %25 %25 %0 %89280739
20NC_007886CATT31739651739761225 %50 %0 %25 %89280739
21NC_007886AAAG31780101780211275 %0 %25 %0 %89280739
22NC_007886CTTG3189723189734120 %50 %25 %25 %89280739
23NC_007886GAAA31954731954841275 %0 %25 %0 %89280739
24NC_007886CTTC3196021196032120 %50 %0 %50 %89280739
25NC_007886TCGC3215485215496120 %25 %25 %50 %89280739
26NC_007886AAGA32281782281891275 %0 %25 %0 %89280739
27NC_007886AGAA32286532286641275 %0 %25 %0 %89280739
28NC_007886TTTG3234923234934120 %75 %25 %0 %89280739
29NC_007886GACT32722452722561225 %25 %25 %25 %89280739
30NC_007886TCGC3274605274616120 %25 %25 %50 %89280739
31NC_007886ACTT32876782876891225 %50 %0 %25 %89280739
32NC_007886GGAA33137623137731250 %0 %50 %0 %89280739
33NC_007886AAAG33137783137891275 %0 %25 %0 %89280739
34NC_007886TCAT33164233164341225 %50 %0 %25 %Non-Coding
35NC_007886GGAA33565733565841250 %0 %50 %0 %Non-Coding
36NC_007886AAGA33729253729361275 %0 %25 %0 %Non-Coding
37NC_007886GCCC3405788405799120 %0 %25 %75 %89280754
38NC_007886GGAA34376864376971250 %0 %50 %0 %89280754
39NC_007886AAGA34540384540491275 %0 %25 %0 %Non-Coding
40NC_007886GAGC34795834795941225 %0 %50 %25 %Non-Coding
41NC_007886ATAG34822484822591250 %25 %25 %0 %Non-Coding