ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Oryza sativa Indica Group mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007886	CT	7	6320	6332	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
2	NC_007886	AG	6	7325	7335	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_007886	GA	6	20857	20867	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
4	NC_007886	AT	6	35229	35240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89280739
5	NC_007886	TA	6	40497	40507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280739
6	NC_007886	TC	6	51801	51811	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	89280739
7	NC_007886	CT	6	55710	55720	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	89280739
8	NC_007886	TC	6	64441	64451	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	89280739
9	NC_007886	CT	7	66567	66580	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	89280739
10	NC_007886	TA	8	68730	68744	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	89280739
11	NC_007886	CT	7	69437	69449	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	89280739
12	NC_007886	CT	6	73384	73394	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	89280739
13	NC_007886	AT	6	78423	78433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280739
14	NC_007886	TC	6	81828	81839	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	89280739
15	NC_007886	AT	6	92934	92945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89280739
16	NC_007886	CT	7	101380	101392	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	89280739
17	NC_007886	AG	6	102385	102395	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
18	NC_007886	GA	6	115917	115927	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
19	NC_007886	AT	6	130289	130300	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	89280739
20	NC_007886	TA	6	135557	135567	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280739
21	NC_007886	GA	6	143508	143518	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
22	NC_007886	GA	6	143544	143554	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
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24	NC_007886	TA	6	148020	148030	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280739
25	NC_007886	CT	6	151034	151045	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	89280739
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34	NC_007886	GA	6	221649	221660	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	89280739
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36	NC_007886	GA	6	222676	222686	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
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40	NC_007886	AG	6	258023	258033	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280739
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50	NC_007886	CT	6	299285	299296	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	89280739
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56	NC_007886	TA	6	357932	357942	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_007886	CT	6	366189	366200	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
58	NC_007886	AG	6	366218	366229	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_007886	AG	6	380720	380730	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_007886	AG	6	383230	383240	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_007886	AT	6	407137	407147	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280754
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63	NC_007886	AT	6	412316	412326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	89280754
64	NC_007886	GA	6	412752	412762	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	89280754
65	NC_007886	AG	7	413679	413692	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	89280754
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74	NC_007886	CT	6	474054	474065	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Oryza sativa Indica Group mitochondrion