ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Dictyostelium citrinum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007787	AAT	4	64	75	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
2	NC_007787	TAA	4	435	446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
3	NC_007787	TTA	4	1205	1216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
4	NC_007787	ATA	4	1290	1300	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
5	NC_007787	TAA	4	1809	1820	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	87043030
6	NC_007787	ATT	4	2180	2190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043030
7	NC_007787	ATT	4	2596	2607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043030
8	NC_007787	ATA	5	2963	2978	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	87043030
9	NC_007787	TAT	5	4262	4276	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	87043029
10	NC_007787	AGA	5	5333	5349	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	29466299
11	NC_007787	TTA	4	7546	7557	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
12	NC_007787	AGG	4	7635	7646	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29466299
13	NC_007787	AGA	5	7729	7743	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	29466299
14	NC_007787	AAG	4	8590	8601	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
15	NC_007787	ATT	4	8942	8953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
16	NC_007787	AAT	4	9007	9017	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
17	NC_007787	ATA	4	12171	12181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
18	NC_007787	TTA	5	13141	13154	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29466299
19	NC_007787	TAT	5	14574	14588	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29466299
20	NC_007787	ATT	4	14807	14818	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
21	NC_007787	GTA	4	15006	15017	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
22	NC_007787	TAT	4	18586	18597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007787	AAT	4	22697	22708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_007787	TAT	4	22712	22723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007787	TTA	5	23879	23894	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	87043020
26	NC_007787	CAG	4	24543	24554	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	87043020
27	NC_007787	ATA	8	25817	25840	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_007787	TAA	4	30020	30030	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	87043017
29	NC_007787	TAA	5	30184	30197	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	87043017
30	NC_007787	TTA	4	30218	30229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043016
31	NC_007787	TAT	4	30396	30407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043016
32	NC_007787	TAT	4	30721	30731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043016
33	NC_007787	ACG	4	30799	30810	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	87043016
34	NC_007787	TTA	4	31247	31257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_007787	CAA	4	33069	33080	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043013
36	NC_007787	GAT	4	33437	33448	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	87043013
37	NC_007787	ATT	4	34382	34393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043012
38	NC_007787	AAT	4	35578	35588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_007787	GAG	4	37033	37043	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	87043009
40	NC_007787	ATA	4	37681	37693	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	87043009
41	NC_007787	CAA	4	38409	38420	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043008
42	NC_007787	ATA	4	38471	38481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	87043008
43	NC_007787	TAA	4	41424	41434	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
44	NC_007787	AGA	4	42214	42225	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
45	NC_007787	ATA	4	42419	42430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
46	NC_007787	ATT	4	42559	42569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29466299
47	NC_007787	TTA	6	43674	43690	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29466299
48	NC_007787	AGT	4	44913	44923	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29466300
49	NC_007787	TAA	4	45632	45643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466300
50	NC_007787	ACA	4	47724	47735	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043036
51	NC_007787	ACA	4	48994	49005	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043034
52	NC_007787	ATT	4	53016	53027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043032
53	NC_007787	ATT	4	53801	53812	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043032
54	NC_007787	TAT	4	54358	54368	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043032
55	NC_007787	AGA	4	56091	56103	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29466300
56	NC_007787	AAG	4	56753	56763	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	29466300
57	NC_007787	ATT	5	57032	57046	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29466300
58	NC_007787	AGA	4	57204	57215	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29466300
59	NC_007787	ATA	4	57295	57306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466300

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Dictyostelium citrinum mitochondrion