ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Dictyostelium citrinum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007787	AAT	4	64	75	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
2	NC_007787	TAA	4	435	446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
3	NC_007787	TTA	4	1205	1216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
4	NC_007787	AATT	3	1257	1267	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29466299
5	NC_007787	ATA	4	1290	1300	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
6	NC_007787	ATTT	3	1337	1348	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29466299
7	NC_007787	TA	7	1708	1720	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	87043030
8	NC_007787	TAA	4	1809	1820	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	87043030
9	NC_007787	ATT	4	2180	2190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043030
10	NC_007787	ATT	4	2596	2607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043030
11	NC_007787	AT	6	2792	2802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	87043030
12	NC_007787	ATA	5	2963	2978	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	87043030
13	NC_007787	CAAA	3	3025	3036	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	87043030
14	NC_007787	TAT	5	4262	4276	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	87043029
15	NC_007787	ACAA	3	4393	4404	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	87043029
16	NC_007787	GAAA	3	4432	4444	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	87043029
17	NC_007787	AGAAA	3	4473	4486	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	87043029
18	NC_007787	AAAG	3	4634	4645	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	87043029
19	NC_007787	AGA	5	5333	5349	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	29466299
20	NC_007787	TTA	4	7546	7557	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
21	NC_007787	AGG	4	7635	7646	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	29466299
22	NC_007787	AGA	5	7729	7743	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	29466299
23	NC_007787	TTTA	3	8038	8048	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29466299
24	NC_007787	AT	6	8100	8110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29466299
25	NC_007787	AAG	4	8590	8601	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
26	NC_007787	AAGA	3	8690	8701	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	29466299
27	NC_007787	ATT	4	8942	8953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
28	NC_007787	AAT	4	9007	9017	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
29	NC_007787	TA	6	9066	9076	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29466299
30	NC_007787	ACAA	3	10922	10933	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	29466299
31	NC_007787	AAAT	3	11257	11267	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29466299
32	NC_007787	ATA	4	12171	12181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
33	NC_007787	A	13	12556	12568	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29466299
34	NC_007787	A	14	12709	12722	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29466299
35	NC_007787	TTAG	3	12917	12928	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	29466299
36	NC_007787	AT	6	13107	13117	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29466299
37	NC_007787	AAAAT	3	13122	13135	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	29466299
38	NC_007787	TTA	5	13141	13154	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29466299
39	NC_007787	TAT	5	14574	14588	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	29466299
40	NC_007787	ATT	4	14807	14818	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29466299
41	NC_007787	GTA	4	15006	15017	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
42	NC_007787	AG	7	15855	15868	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_007787	TA	6	16442	16452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_007787	GAAA	3	16492	16503	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_007787	TAT	4	18586	18597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_007787	GCAAA	3	19290	19304	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
47	NC_007787	GAAAAG	3	19733	19751	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_007787	AAT	4	22697	22708	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_007787	TAT	4	22712	22723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_007787	ATTT	3	23254	23265	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_007787	AATA	3	23496	23507	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_007787	TTA	5	23879	23894	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	87043020
53	NC_007787	CAG	4	24543	24554	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	87043020
54	NC_007787	AT	6	24619	24630	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	87043020
55	NC_007787	AAAT	3	24667	24677	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	87043020
56	NC_007787	ATA	8	25817	25840	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_007787	TAAAA	4	25900	25919	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_007787	AT	6	26173	26183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_007787	GAAA	3	29228	29238	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	87043017
60	NC_007787	CAGAAG	3	29878	29895	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	87043017
61	NC_007787	TAA	4	30020	30030	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	87043017
62	NC_007787	TAA	5	30184	30197	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	87043017
63	NC_007787	TTA	4	30218	30229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043016
64	NC_007787	TAT	4	30396	30407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043016
65	NC_007787	TAT	4	30721	30731	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043016
66	NC_007787	ACG	4	30799	30810	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	87043016
67	NC_007787	TTA	4	31247	31257	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_007787	CAGGAG	4	31655	31678	24	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	8 %	87043015
69	NC_007787	ATAA	3	32565	32576	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	87043014
70	NC_007787	AAAAT	3	32664	32678	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	87043014
71	NC_007787	CAA	4	33069	33080	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043013
72	NC_007787	GAT	4	33437	33448	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	87043013
73	NC_007787	AAGA	3	33508	33519	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	87043013
74	NC_007787	TAGA	3	33894	33905	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	87043013
75	NC_007787	GAAA	3	33906	33917	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_007787	ATT	4	34382	34393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043012
77	NC_007787	AAAAG	3	34929	34943	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_007787	AGAA	3	35122	35134	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	29466299
79	NC_007787	AAT	4	35578	35588	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_007787	A	17	36084	36100	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	29466299
81	NC_007787	TAAA	3	36212	36222	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29466299
82	NC_007787	A	13	36650	36662	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	87043010
83	NC_007787	GAG	4	37033	37043	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	87043009
84	NC_007787	AT	6	37057	37068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	87043009
85	NC_007787	ATTA	3	37222	37232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	87043009
86	NC_007787	ATTA	3	37372	37382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	87043009
87	NC_007787	ATA	4	37681	37693	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	87043009
88	NC_007787	A	14	37721	37734	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	87043009
89	NC_007787	AAAAT	4	38172	38190	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	87043008
90	NC_007787	A	13	38387	38399	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	87043008
91	NC_007787	CAA	4	38409	38420	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043008
92	NC_007787	ATA	4	38471	38481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	87043008
93	NC_007787	AAAC	3	39009	39019	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	87043008
94	NC_007787	TTAA	3	39103	39114	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	87043008
95	NC_007787	ACAA	4	39307	39322	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	29466299
96	NC_007787	A	12	39673	39684	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29466299
97	NC_007787	A	12	40042	40053	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	29466299
98	NC_007787	AACA	3	40894	40904	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	29466299
99	NC_007787	AAAT	3	41303	41313	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29466299
100	NC_007787	ATAA	3	41392	41402	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29466299
101	NC_007787	TAA	4	41424	41434	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29466299
102	NC_007787	CGAA	3	42164	42175	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	29466299
103	NC_007787	AGA	4	42214	42225	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29466299
104	NC_007787	ATA	4	42419	42430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466299
105	NC_007787	ATT	4	42559	42569	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29466299
106	NC_007787	A	12	42811	42822	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	29466299
107	NC_007787	A	17	42864	42880	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	29466299
108	NC_007787	A	13	43047	43059	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29466299
109	NC_007787	TAAA	3	43172	43182	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29466299
110	NC_007787	TTA	6	43674	43690	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	29466299
111	NC_007787	AGT	4	44913	44923	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29466300
112	NC_007787	TAA	4	45632	45643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466300
113	NC_007787	AATGAA	3	46732	46750	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	87043038
114	NC_007787	A	16	47319	47334	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	87043036
115	NC_007787	ACA	4	47724	47735	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043036
116	NC_007787	AAAT	3	48447	48457	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	87043034
117	NC_007787	AAAT	3	48540	48551	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	87043034
118	NC_007787	ACA	4	48994	49005	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	87043034
119	NC_007787	ACAA	3	49073	49084	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	87043034
120	NC_007787	ATATT	3	49096	49110	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	87043034
121	NC_007787	GAAATC	3	49869	49886	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	87043034
122	NC_007787	AAGA	3	50424	50435	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	87043034
123	NC_007787	AAATA	4	52470	52489	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	29466300
124	NC_007787	AGAAA	4	52530	52549	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	29466300
125	NC_007787	ATT	4	53016	53027	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043032
126	NC_007787	ATT	4	53801	53812	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	87043032
127	NC_007787	TAT	4	54358	54368	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	87043032
128	NC_007787	T	12	54431	54442	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	87043032
129	NC_007787	A	13	55598	55610	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	29466300
130	NC_007787	ATAAAT	4	56008	56031	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29466300
131	NC_007787	AGA	4	56091	56103	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	29466300
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133	NC_007787	AT	6	56468	56479	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29466300
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139	NC_007787	TTAAA	3	57507	57520	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	29466300

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Dictyostelium citrinum mitochondrion