ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hanseniaspora uvarum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007780	ATA	4	360	370	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007780	AT	6	454	464	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_007780	TA	8	711	725	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_007780	AT	7	1247	1259	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007780	ATTA	3	2212	2223	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007780	TAT	4	2235	2245	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_007780	ATATT	3	3000	3013	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_007780	ATT	4	3479	3490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007780	TA	6	4101	4111	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007780	TTA	4	4207	4219	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	86990311
11	NC_007780	TTA	4	5020	5032	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	86990312
12	NC_007780	TAG	4	5039	5050	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	86990312
13	NC_007780	TTA	4	6040	6051	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	86990313
14	NC_007780	ATT	5	6473	6487	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	86990313
15	NC_007780	TAT	4	6517	6527	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	86990313
16	NC_007780	ATTA	3	7082	7094	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	86990313
17	NC_007780	TAT	4	8086	8098	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	86990313
18	NC_007780	TCA	4	8223	8234	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	86990313
19	NC_007780	TTAA	3	9534	9545	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	86990314
20	NC_007780	TAA	4	9964	9975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	86990314
21	NC_007780	TAA	4	10087	10097	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	86990314
22	NC_007780	ATA	4	10166	10176	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	86990314
23	NC_007780	AAGT	3	10325	10336	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	86990315
24	NC_007780	TAT	4	10462	10473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007780	ATA	4	11053	11063	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_007780	TAA	4	12778	12789	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	86990316
27	NC_007780	TAT	4	12912	12923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	86990316
28	NC_007780	GAA	4	13417	13429	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	86990316
29	NC_007780	TAT	4	13686	13697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	86990316
30	NC_007780	AT	6	14029	14040	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_007780	TAA	4	15354	15365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007780	TAGTA	3	15774	15788	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_007780	TAG	4	15866	15877	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_007780	ATA	4	16602	16612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_007780	TAAT	3	16622	16633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_007780	AT	7	17586	17598	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_007780	CATA	3	17800	17810	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_007780	AT	8	18119	18133	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_007780	TA	6	18137	18148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_007780	AT	6	18381	18391	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_007780	CATA	3	18639	18649	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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