ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Theileria parva strain Muguga apicoplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007758	ATC	4	1259	1270	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_007758	ATTTT	3	1341	1355	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_007758	TAT	4	1736	1746	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_007758	TTTAAA	3	1911	1928	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_007758	TAAA	3	2258	2270	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_007758	TTA	4	2426	2437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007758	TAAA	3	2436	2447	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007758	TTAA	3	2784	2794	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_007758	TAA	4	2799	2811	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_007758	AATT	3	3385	3396	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007758	ATATAA	3	4609	4627	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_007758	TTTAT	4	4676	4696	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_007758	A	14	4879	4892	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	71025925
14	NC_007758	AT	7	5489	5501	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_007758	TA	6	5552	5562	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_007758	AT	6	5838	5848	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_007758	CTTT	3	6598	6609	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007758	AAAT	3	6801	6813	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	71025927
19	NC_007758	ATC	4	6873	6884	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	71025927
20	NC_007758	AAAT	3	7016	7027	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025927
21	NC_007758	ATA	5	7046	7060	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	71025927
22	NC_007758	TAA	4	7620	7631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025930
23	NC_007758	TTAA	3	8077	8088	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71025932
24	NC_007758	ATA	4	8201	8211	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025934
25	NC_007758	TATT	3	8256	8267	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	71025934
26	NC_007758	ATT	4	8391	8402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025934
27	NC_007758	TGAA	3	9157	9168	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	71025936
28	NC_007758	TAAA	3	9545	9555	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	71025941
29	NC_007758	TAAA	3	9723	9734	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025941
30	NC_007758	TA	7	9884	9896	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	71025943
31	NC_007758	AAT	4	9899	9911	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	71025943
32	NC_007758	AT	6	10195	10206	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71025943
33	NC_007758	AAAGAA	3	10284	10301	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	71025943
34	NC_007758	ATA	4	10836	10847	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025945
35	NC_007758	ATA	4	11120	11130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025947
36	NC_007758	CTT	4	11183	11194	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	71025947
37	NC_007758	AAAT	3	11573	11584	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025949
38	NC_007758	AATT	3	11644	11654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025949
39	NC_007758	AAT	4	11935	11946	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025951
40	NC_007758	AT	6	11945	11955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025951
41	NC_007758	A	12	12103	12114	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	71025951
42	NC_007758	TTTAA	4	12723	12742	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	71025954
43	NC_007758	AAATT	3	12746	12760	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	71025954
44	NC_007758	AACA	3	12926	12937	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	71025958
45	NC_007758	CTTT	3	13029	13039	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	71025958
46	NC_007758	TAAAAA	3	13082	13099	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	71025958
47	NC_007758	TAA	4	13147	13159	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	71025958
48	NC_007758	TAAA	3	13163	13174	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025958
49	NC_007758	A	13	13385	13397	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	71025960
50	NC_007758	TA	7	13934	13947	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	71025963
51	NC_007758	TAT	4	14174	14185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025963
52	NC_007758	TAA	4	14305	14316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025963
53	NC_007758	AAAAGA	3	14517	14535	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	71025965
54	NC_007758	TGA	4	14781	14792	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	71025965
55	NC_007758	TAAA	3	14927	14937	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	71025965
56	NC_007758	TA	6	15311	15321	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025965
57	NC_007758	AAAT	3	15407	15418	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025965
58	NC_007758	AACA	3	15636	15647	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_007758	TAAAA	3	16145	16159	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	71025969
60	NC_007758	AT	11	16167	16187	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025969
61	NC_007758	AAAATA	3	16499	16515	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	71025969
62	NC_007758	AT	6	16543	16553	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025969
63	NC_007758	T	12	17192	17203	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_007758	ATAA	3	17509	17520	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025971
65	NC_007758	A	14	17872	17885	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	71025971
66	NC_007758	TA	6	17929	17940	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71025971
67	NC_007758	ATT	4	18350	18360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025974
68	NC_007758	AT	6	18495	18505	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025974
69	NC_007758	TAA	6	18782	18800	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	71025974
70	NC_007758	TA	6	19499	19509	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025974
71	NC_007758	TAT	4	19574	19585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025974
72	NC_007758	AT	6	19840	19851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71025976
73	NC_007758	TAT	4	20120	20130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025976
74	NC_007758	A	13	20178	20190	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	71025976
75	NC_007758	GTAA	3	20236	20247	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	71025976
76	NC_007758	ATTT	3	20852	20864	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	71025976
77	NC_007758	ATA	4	20980	20990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025976
78	NC_007758	AAT	4	21655	21666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025980
79	NC_007758	AATT	3	21936	21946	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025982
80	NC_007758	AT	6	22165	22175	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71025985
81	NC_007758	AAAT	3	22201	22212	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	71025985
82	NC_007758	AATAT	3	22407	22420	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	71025985
83	NC_007758	TTTAAA	3	22829	22846	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	71025985
84	NC_007758	TAAA	3	23435	23446	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	71025985
85	NC_007758	AAAC	3	24221	24231	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	71025985
86	NC_007758	TTAA	3	24664	24675	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71025985
87	NC_007758	A	12	25261	25272	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	71025987
88	NC_007758	AAAC	3	26002	26013	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	71025987
89	NC_007758	TA	6	26754	26766	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_007758	AATT	3	26781	26791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_007758	TAT	5	27006	27019	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_007758	TTTA	3	27725	27737	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	71025989
93	NC_007758	AT	10	27994	28014	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_007758	TAT	4	28311	28323	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_007758	ATA	4	28408	28420	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_007758	TAA	4	28825	28835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_007758	TAAAA	3	29081	29095	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_007758	TAT	4	29611	29621	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025993
99	NC_007758	TTA	4	30009	30020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025998
100	NC_007758	TTAA	3	30102	30114	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_007758	TAAAA	3	30318	30331	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_007758	ATA	4	30608	30619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026000
103	NC_007758	TA	7	30653	30665	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	71026000
104	NC_007758	TAT	4	30847	30857	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026000
105	NC_007758	TTA	4	31244	31255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71026004
106	NC_007758	TTAA	3	31337	31349	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_007758	TAAAA	3	31554	31568	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_007758	TA	6	31894	31904	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71026007
109	NC_007758	TTTA	3	32016	32028	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	71026007
110	NC_007758	AT	8	32184	32199	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	71026009
111	NC_007758	AT	6	32513	32524	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_007758	TTA	4	32729	32740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71026012
113	NC_007758	TTAA	3	32822	32834	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_007758	TAAAA	3	33039	33053	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_007758	TAT	4	33568	33578	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026014
116	NC_007758	TTTAA	3	33660	33673	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	71026016
117	NC_007758	ATTTAT	3	33868	33885	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	71026016
118	NC_007758	ATA	4	34522	34532	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71026016
119	NC_007758	AAAT	3	34547	34557	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	71026016
120	NC_007758	TA	6	35116	35126	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71026018
121	NC_007758	TAT	4	35239	35249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026018
122	NC_007758	AT	6	35375	35385	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71026018
123	NC_007758	AT	6	35759	35769	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	71026021
124	NC_007758	TAA	4	35873	35884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026021
125	NC_007758	AATT	3	35909	35920	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71026021
126	NC_007758	TAA	4	35934	35945	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026021
127	NC_007758	TA	6	36271	36282	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	71026021
128	NC_007758	TTCT	3	36751	36762	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007758	AT	7	36988	37001	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_007758	TTCT	3	37181	37192	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007758	AT	7	37419	37432	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_007758	AT	7	37849	37862	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_007758	TTCT	3	38042	38053	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007758	AT	8	38280	38295	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
135	NC_007758	TTCT	3	38475	38486	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007758	AT	7	38712	38725	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_007758	ATAA	3	39015	39026	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007758	TTTAA	3	39260	39275	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_007758	AATAT	3	39332	39346	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Theileria parva strain Muguga apicoplast