ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Theileria parva strain Muguga apicoplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007758	ATC	4	1259	1270	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_007758	TAT	4	1736	1746	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_007758	TTA	4	2426	2437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007758	TAA	4	2799	2811	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007758	ATC	4	6873	6884	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	71025927
6	NC_007758	ATA	5	7046	7060	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	71025927
7	NC_007758	TAA	4	7620	7631	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025930
8	NC_007758	ATA	4	8201	8211	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025934
9	NC_007758	ATT	4	8391	8402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025934
10	NC_007758	AAT	4	9899	9911	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	71025943
11	NC_007758	ATA	4	10836	10847	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025945
12	NC_007758	ATA	4	11120	11130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025947
13	NC_007758	CTT	4	11183	11194	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	71025947
14	NC_007758	AAT	4	11935	11946	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025951
15	NC_007758	TAA	4	13147	13159	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	71025958
16	NC_007758	TAT	4	14174	14185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025963
17	NC_007758	TAA	4	14305	14316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025963
18	NC_007758	TGA	4	14781	14792	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	71025965
19	NC_007758	ATT	4	18350	18360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025974
20	NC_007758	TAA	6	18782	18800	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	71025974
21	NC_007758	TAT	4	19574	19585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025974
22	NC_007758	TAT	4	20120	20130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025976
23	NC_007758	ATA	4	20980	20990	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71025976
24	NC_007758	AAT	4	21655	21666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71025980
25	NC_007758	TAT	5	27006	27019	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_007758	TAT	4	28311	28323	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_007758	ATA	4	28408	28420	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_007758	TAA	4	28825	28835	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_007758	TAT	4	29611	29621	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71025993
30	NC_007758	TTA	4	30009	30020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71025998
31	NC_007758	ATA	4	30608	30619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026000
32	NC_007758	TAT	4	30847	30857	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026000
33	NC_007758	TTA	4	31244	31255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71026004
34	NC_007758	TTA	4	32729	32740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71026012
35	NC_007758	TAT	4	33568	33578	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026014
36	NC_007758	ATA	4	34522	34532	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71026016
37	NC_007758	TAT	4	35239	35249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71026018
38	NC_007758	TAA	4	35873	35884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026021
39	NC_007758	TAA	4	35934	35945	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71026021

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Theileria parva strain Muguga apicoplast