ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sclerophasma paresisense mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007701	AAT	4	624	635	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488735
2	NC_007701	ATA	4	661	672	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488735
3	NC_007701	TAT	4	1064	1074	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	84488735
4	NC_007701	TAT	4	2015	2026	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488736
5	NC_007701	GGA	4	2101	2111	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	84488736
6	NC_007701	TATTTT	3	2828	2846	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	84488736
7	NC_007701	TAT	4	3132	3143	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488737
8	NC_007701	TATT	3	3254	3264	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	84488737
9	NC_007701	ATT	4	3282	3292	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	84488737
10	NC_007701	TTTTAT	3	3891	3909	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	84488738
11	NC_007701	TTA	4	3911	3922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488738
12	NC_007701	TTAA	3	4073	4084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	84488739
13	NC_007701	TTA	4	4586	4597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488739
14	NC_007701	TAT	4	4819	4830	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488740
15	NC_007701	AATAA	3	5538	5552	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_007701	TAA	4	5575	5586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488741
17	NC_007701	ATT	4	5790	5800	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	84488741
18	NC_007701	AAAT	3	6108	6119	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007701	TAA	5	6315	6328	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	84488742
20	NC_007701	CAAA	3	6630	6640	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	84488742
21	NC_007701	TA	8	7512	7526	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	84488742
22	NC_007701	TCAA	4	7860	7875	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	84488742
23	NC_007701	AAAT	6	7982	8006	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	84488742
24	NC_007701	TA	6	8246	8259	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	84488743
25	NC_007701	AAT	6	9151	9167	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	84488743
26	NC_007701	ATAAAA	3	9412	9430	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	84488743
27	NC_007701	AAAC	3	9673	9684	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	84488744
28	NC_007701	AT	8	9709	9724	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	84488744
29	NC_007701	TATTA	3	9889	9902	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	84488745
30	NC_007701	ACAA	3	9929	9940	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	84488745
31	NC_007701	TAT	4	9958	9969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488745
32	NC_007701	ATA	4	10149	10160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488745
33	NC_007701	ACT	4	10164	10174	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	84488745
34	NC_007701	TTA	4	11294	11305	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84488746
35	NC_007701	CAAT	3	11349	11360	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	84488746
36	NC_007701	ATA	5	12037	12051	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	84488747
37	NC_007701	AAAT	3	12679	12691	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_007701	AATA	4	12978	12993	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_007701	AAAT	4	13364	13379	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_007701	ATA	4	13486	13496	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_007701	AAT	4	13572	13584	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_007701	ATAA	3	13779	13789	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_007701	TA	7	13852	13864	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_007701	ATA	9	13897	13923	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_007701	AATA	3	14674	14684	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_007701	AAAT	3	14772	14783	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_007701	TTA	5	15100	15113	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_007701	TA	8	15162	15176	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_007701	TAA	4	15195	15207	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_007701	TAA	4	15258	15269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_007701	AT	6	15345	15355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_007701	TAAA	3	15481	15491	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sclerophasma paresisense mitochondrion