ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Malacochersus tornieri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007700	TAC	5	260	274	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
2	NC_007700	CTAT	3	349	361	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007700	ATTC	3	423	435	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
4	NC_007700	TAT	4	608	619	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007700	TTACC	4	939	957	19	20 %	40 %	0 %	40 %	10 %	Non-Coding
6	NC_007700	ATTC	3	966	978	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
7	NC_007700	TAT	4	1151	1162	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007700	ATT	4	1407	1418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007700	TAT	4	1673	1684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007700	TAC	4	1919	1930	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007700	GCAA	3	2989	2999	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_007700	AAT	4	3144	3158	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_007700	ACA	4	3159	3169	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_007700	GTTC	3	4520	4531	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_007700	TTAA	3	6637	6647	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	84488792
16	NC_007700	ATA	4	6715	6726	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488792
17	NC_007700	CTA	5	7737	7751	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	84488793
18	NC_007700	GCAGGC	3	7770	7787	18	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	5 %	84488793
19	NC_007700	TAT	5	8180	8195	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	84488793
20	NC_007700	CTT	4	8441	8452	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	84488793
21	NC_007700	ATA	4	8808	8819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84488793
22	NC_007700	AACC	3	9626	9637	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	84488794
23	NC_007700	AAAAT	4	9966	9984	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	84488795
24	NC_007700	AAC	4	10563	10574	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	84488796
25	NC_007700	GCA	4	10755	10766	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	84488797
26	NC_007700	TCA	4	10951	10961	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	84488797
27	NC_007700	TTC	4	10968	10979	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	84488797
28	NC_007700	TAC	5	12279	12293	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	84488800
29	NC_007700	TA	6	12748	12758	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	84488800
30	NC_007700	TAA	4	13597	13607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	84488800
31	NC_007700	CATT	3	13950	13960	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	84488801
32	NC_007700	TCCA	3	14861	14871	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	84488801
33	NC_007700	TAC	4	15615	15629	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	84488801
34	NC_007700	CAAA	3	16120	16130	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	84488802
35	NC_007700	ATA	4	17664	17674	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_007700	TAT	4	18499	18510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_007700	CAC	4	18638	18649	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
38	NC_007700	TTACC	4	18722	18740	19	20 %	40 %	0 %	40 %	10 %	Non-Coding
39	NC_007700	ATTC	3	18749	18761	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
40	NC_007700	TAT	4	18932	18943	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_007700	CAC	4	19071	19082	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Malacochersus tornieri mitochondrion