ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Desmarestia viridis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007684	ACA	5	3829	3844	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
2	NC_007684	TC	6	4011	4021	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_007684	TTTA	3	5799	5810	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	84508595
4	NC_007684	TTA	4	5905	5916	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	84508595
5	NC_007684	TTCA	3	6918	6928	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	84508596
6	NC_007684	TTTC	3	7118	7129	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	84508596
7	NC_007684	TTTG	3	8093	8104	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	84508597
8	NC_007684	CTTT	4	8201	8215	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	84508597
9	NC_007684	AAGT	3	10828	10838	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007684	AAAT	3	11008	11019	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	84508602
11	NC_007684	GTTT	3	12188	12199	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	84508604
12	NC_007684	ACCTT	3	12389	12404	16	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	84508605
13	NC_007684	CTA	4	14348	14358	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	84508608
14	NC_007684	AAAT	3	14501	14511	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	84508608
15	NC_007684	TGTTT	3	14512	14525	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	84508608
16	NC_007684	TAA	4	15070	15081	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	84508610
17	NC_007684	TTC	4	15920	15932	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	84508611
18	NC_007684	GCTTTT	3	16018	16035	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	84508611
19	NC_007684	TTTG	3	16883	16894	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	84508612
20	NC_007684	AATA	3	17011	17021	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	84508612
21	NC_007684	GTA	4	17603	17613	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	84508612
22	NC_007684	AGA	4	17712	17722	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	84508612
23	NC_007684	ATT	4	19263	19273	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	84508614
24	NC_007684	T	13	19639	19651	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	84508614
25	NC_007684	ATTT	3	20427	20437	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	84508614
26	NC_007684	GTG	4	21341	21351	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	84508615
27	NC_007684	TTTTTG	3	23881	23898	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	84508617
28	NC_007684	TTTG	3	24262	24273	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	84508617
29	NC_007684	TTG	4	26732	26743	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84508618
30	NC_007684	GAA	4	28027	28038	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	84508618
31	NC_007684	TATT	5	28655	28673	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	84508619
32	NC_007684	TCT	4	28805	28815	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	84508619
33	NC_007684	TTTAT	4	34307	34326	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	84508625
34	NC_007684	TAG	4	34371	34382	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	84508625
35	NC_007684	CATA	3	34688	34699	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_007684	TC	6	34903	34914	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_007684	AAATA	3	35307	35321	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	84508626
38	NC_007684	CTAG	3	35328	35339	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	84508626
39	NC_007684	TTAA	3	35441	35451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	84508627
40	NC_007684	TTTA	3	35489	35500	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	84508627
41	NC_007684	TA	6	35635	35645	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	84508627
42	NC_007684	AAAG	3	35759	35769	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_007684	ATAA	3	36038	36049	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_007684	GTAGAA	3	36515	36531	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_007684	AT	6	38156	38166	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	84508628

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Desmarestia viridis mitochondrion