ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tomentosiformis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007602	TAT	4	173	183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007602	AAG	5	2993	3007	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	81301542
3	NC_007602	GAA	4	4418	4429	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007602	ATA	4	6436	6448	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007602	CGG	4	11687	11697	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	81301547
6	NC_007602	ATT	4	24209	24221	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_007602	CAG	4	28872	28883	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007602	TAG	4	32449	32460	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007602	ATT	4	33004	33014	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_007602	GAG	4	35990	36000	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	81301559
11	NC_007602	TTC	4	36720	36731	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301559
12	NC_007602	TAA	4	43876	43887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_007602	GTA	4	46409	46419	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_007602	AAT	4	47295	47306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_007602	TTA	5	53138	53153	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_007602	AGA	4	53207	53218	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_007602	TTA	4	53712	53723	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007602	CAA	4	54370	54381	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007602	ATA	4	56683	56696	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81301573
20	NC_007602	TTG	4	57437	57447	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_007602	TTG	4	59171	59181	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_007602	TAA	4	59514	59526	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_007602	TCT	4	61464	61474	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_007602	ATT	4	65400	65411	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007602	GTT	4	67355	67365	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_007602	AAT	4	69673	69684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_007602	TCT	4	76144	76155	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81301619
28	NC_007602	AGA	4	79141	79151	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81301619
29	NC_007602	TTA	4	86165	86176	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81301619
30	NC_007602	CTT	4	86586	86597	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81301619
31	NC_007602	GAT	4	87053	87063	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81301619
32	NC_007602	GAT	4	88427	88437	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81301619
33	NC_007602	TGA	4	93178	93189	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	81301619
34	NC_007602	TTC	4	101009	101020	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81301592
35	NC_007602	ATT	4	112589	112601	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81301592
36	NC_007602	TAA	4	113003	113014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81301592
37	NC_007602	AAG	4	113228	113239	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81301592
38	NC_007602	ATA	4	115156	115166	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	81301592
39	NC_007602	TAT	4	120703	120714	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81301592
40	NC_007602	TTC	5	121836	121850	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	81301592
41	NC_007602	TTA	4	130276	130287	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81301592
42	NC_007602	GAA	4	141118	141129	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81301592
43	NC_007602	ATC	4	153701	153711	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_007602	ATC	4	155075	155085	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81301649
45	NC_007602	GAA	5	155540	155554	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	81301649

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tomentosiformis chloroplast