ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspergillus tubingensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007597	AGTTAT	3	354	371	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	81230395
2	NC_007597	AAAT	3	1153	1163	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	81230395
3	NC_007597	GC	6	1488	1499	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007597	ATAGTT	3	1618	1635	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_007597	A	13	1777	1789	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	81230385
6	NC_007597	ATT	4	1818	1830	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81230385
7	NC_007597	TAT	7	2252	2272	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230385
8	NC_007597	TCT	4	2468	2479	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81230385
9	NC_007597	ATT	4	2967	2978	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230398
10	NC_007597	ATTT	3	3044	3054	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	81230398
11	NC_007597	TAAC	3	3463	3473	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81230398
12	NC_007597	ATT	5	3517	3530	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81230398
13	NC_007597	TA	6	3563	3573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	81230398
14	NC_007597	CAAT	4	4715	4729	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
15	NC_007597	TAA	7	4767	4787	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_007597	ATA	8	4835	4858	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_007597	ATCCT	3	4958	4971	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
18	NC_007597	ATA	4	5042	5053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007597	TA	7	5449	5462	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_007597	TAT	4	5473	5484	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230386
21	NC_007597	TAT	5	5863	5876	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81230386
22	NC_007597	TTA	4	5904	5915	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230386
23	NC_007597	ATT	4	6083	6094	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230386
24	NC_007597	A	15	6931	6945	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	81230386
25	NC_007597	TATAAT	3	6946	6963	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_007597	TAT	4	6996	7007	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_007597	AAT	4	7069	7079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_007597	ATA	4	7764	7775	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81230397
29	NC_007597	TTC	4	8231	8242	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81230397
30	NC_007597	A	16	8710	8725	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_007597	T	15	8962	8976	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_007597	AGT	4	9141	9152	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_007597	GATAAT	3	9475	9492	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_007597	ATA	5	10507	10521	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_007597	CTC	4	10696	10706	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
36	NC_007597	TTC	4	11746	11757	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81230392
37	NC_007597	ATC	4	12158	12169	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81230392
38	NC_007597	TTG	4	12203	12214	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	81230392
39	NC_007597	TTA	4	12252	12264	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81230392
40	NC_007597	TAT	4	12303	12313	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_007597	TA	6	12411	12422	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_007597	A	16	12577	12592	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_007597	AATAA	3	12768	12782	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_007597	AAAT	3	13102	13113	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_007597	ATAATT	4	13116	13138	23	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_007597	ATTAAT	3	14600	14618	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
47	NC_007597	ATT	7	14676	14695	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_007597	TATT	3	14818	14829	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_007597	TAA	4	14859	14871	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_007597	TAATA	3	14895	14910	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_007597	T	12	14924	14935	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_007597	AGTA	3	15085	15096	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_007597	ATT	4	15177	15188	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_007597	TTATAT	3	15776	15793	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_007597	ATT	4	16426	16437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_007597	TAA	4	16441	16452	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_007597	TA	8	16518	16532	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_007597	AAG	4	17306	17317	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_007597	ATA	7	17759	17779	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_007597	TA	13	18137	18160	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_007597	TAT	6	18736	18753	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007597	T	12	19187	19198	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007597	TAT	5	19201	19214	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_007597	TAA	4	19745	19757	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_007597	TA	7	19881	19893	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_007597	AT	9	20016	20032	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_007597	T	17	20089	20105	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_007597	TAT	7	20813	20833	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230394
69	NC_007597	TTAT	3	20897	20908	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	81230394
70	NC_007597	AGAC	3	21503	21514	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	81230394
71	NC_007597	TAT	6	23195	23215	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230394
72	NC_007597	TAT	5	23719	23732	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81230394
73	NC_007597	TTAA	3	24142	24154	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	81230394
74	NC_007597	T	12	26609	26620	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	81230400
75	NC_007597	TTA	4	26660	26670	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230400
76	NC_007597	A	17	26755	26771	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_007597	TTAA	4	26780	26794	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_007597	T	17	26798	26814	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_007597	TAT	5	26817	26830	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_007597	TTATAA	3	27202	27219	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	81230388
81	NC_007597	T	16	27336	27351	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007597	ATA	4	27639	27649	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	81230393
83	NC_007597	ATT	4	27832	27842	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230393
84	NC_007597	ATG	4	27930	27941	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	81230393
85	NC_007597	TAATT	3	28289	28302	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	81230393
86	NC_007597	TAT	4	28350	28361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_007597	AT	18	28482	28515	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_007597	AT	6	28691	28704	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_007597	ATTT	3	28732	28743	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	81230389
90	NC_007597	TA	6	28889	28899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	81230389
91	NC_007597	TTTA	3	29328	29339	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	81230390
92	NC_007597	TATT	3	29627	29638	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	81230390
93	NC_007597	ATT	4	29999	30010	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230390
94	NC_007597	TTA	4	31004	31015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_007597	A	13	31042	31054	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_007597	T	16	31081	31096	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007597	TAT	4	31219	31229	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230391
98	NC_007597	ATTAT	3	31616	31629	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	81230391
99	NC_007597	ATC	4	31652	31663	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81230391
100	NC_007597	TTA	4	31708	31718	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81230391
101	NC_007597	TTA	4	32058	32069	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81230391
102	NC_007597	TTAA	3	32593	32604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	81230391
103	NC_007597	TA	9	32852	32869	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_007597	TAA	4	32977	32988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_007597	A	13	32984	32996	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_007597	TATAA	3	33156	33169	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_007597	TAAGAT	3	33424	33442	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspergillus tubingensis mitochondrion