ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007579	GCAA	3	2263	2275	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_007579	TGTT	3	11725	11735	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_007579	TTCC	3	12056	12067	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007579	GATC	3	13177	13188	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007579	GCTT	3	13468	13478	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_007579	AGGG	3	15633	15644	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007579	GAAT	3	15836	15846	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_007579	CAGT	3	16872	16882	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	81176539
9	NC_007579	GCTC	3	20317	20329	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176539
10	NC_007579	AACT	3	20574	20584	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
11	NC_007579	TTAG	3	20598	20610	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	81176539
12	NC_007579	TCCA	3	24108	24119	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	81176539
13	NC_007579	TTCA	3	26103	26114	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	81176539
14	NC_007579	CTCG	3	26457	26467	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	81176539
15	NC_007579	AACT	3	27821	27831	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
16	NC_007579	CTGG	3	27936	27948	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	81176539
17	NC_007579	AAAG	3	31482	31492	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	81176539
18	NC_007579	AACC	3	32047	32057	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	81176539
19	NC_007579	CCTT	3	32653	32664	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	81176539
20	NC_007579	ATTC	3	41728	41739	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	81176539
21	NC_007579	TCAT	4	43825	43840	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	81176539
22	NC_007579	CATT	3	50963	50973	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
23	NC_007579	GTTC	3	52925	52936	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	81176539
24	NC_007579	CATT	3	55095	55106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	81176539
25	NC_007579	TCAT	5	56345	56365	21	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
26	NC_007579	CTTG	3	60054	60064	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	81176539
27	NC_007579	TGAT	3	65732	65744	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	81176539
28	NC_007579	GAAG	3	70426	70436	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	81176539
29	NC_007579	ACGA	3	70551	70561	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
30	NC_007579	AAGC	3	76980	76990	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
31	NC_007579	CCGT	3	77582	77593	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	81176539
32	NC_007579	TAGA	3	78008	78020	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	81176539
33	NC_007579	GATA	3	79488	79498	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	81176539
34	NC_007579	TAGA	5	82596	82614	19	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	81176539
35	NC_007579	TAAC	3	82796	82806	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
36	NC_007579	GCTC	3	86193	86205	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176539
37	NC_007579	AAAG	3	86388	86399	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	81176539
38	NC_007579	TAAA	3	86585	86596	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	81176539
39	NC_007579	TAAC	3	88889	88899	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
40	NC_007579	CTTC	3	91424	91435	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	81176539
41	NC_007579	AATG	3	92043	92054	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	81176539
42	NC_007579	AAGC	3	92906	92916	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
43	NC_007579	GCAA	3	98131	98142	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	81176539
44	NC_007579	TACC	3	98257	98267	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176539
45	NC_007579	CTCG	3	100482	100492	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	81176539
46	NC_007579	AAGC	3	101006	101016	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
47	NC_007579	TGGG	3	101076	101086	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	81176539
48	NC_007579	CTGG	3	101705	101715	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	81176539
49	NC_007579	GAAA	3	102084	102094	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	81176539
50	NC_007579	GGAA	4	103479	103494	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	81176539
51	NC_007579	TACT	3	103673	103683	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
52	NC_007579	AGGG	3	104958	104969	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	81176539
53	NC_007579	AGTC	3	104970	104980	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	81176539
54	NC_007579	CAAC	3	105694	105704	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	81176539
55	NC_007579	CAAA	3	107900	107910	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	81176539
56	NC_007579	AAAG	4	112350	112365	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	81176539
57	NC_007579	CCTT	3	114633	114645	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	81176539
58	NC_007579	TTTC	3	115990	116000	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	81176539
59	NC_007579	CTTT	4	116660	116675	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	81176539
60	NC_007579	GGTG	3	119482	119493	12	0 %	25 %	75 %	0 %	0 %	81176539
61	NC_007579	GGAA	3	120160	120170	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	81176539
62	NC_007579	AATC	3	127083	127093	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
63	NC_007579	AAAT	3	127181	127192	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	81176539
64	NC_007579	AAAT	3	128936	128947	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	81176539
65	NC_007579	GGGC	3	138689	138700	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	81176539
66	NC_007579	CAAA	3	138953	138964	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	81176539
67	NC_007579	TAGC	3	140195	140206	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	81176539
68	NC_007579	GGAC	3	141943	141953	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	81176539
69	NC_007579	GGCA	3	142143	142153	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	81176539
70	NC_007579	TGGA	3	147339	147349	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	81176539
71	NC_007579	AAGA	3	149702	149713	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	81176539
72	NC_007579	TGCT	3	152377	152389	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	81176539
73	NC_007579	TTAT	3	156980	156991	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	81176539
74	NC_007579	AAGG	3	158024	158035	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	81176539
75	NC_007579	AGGT	4	163497	163511	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	81176539
76	NC_007579	CTTT	3	164165	164175	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	81176539
77	NC_007579	GAAA	3	167147	167158	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	81176539
78	NC_007579	TACT	3	168003	168015	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	81176539
79	NC_007579	TCCA	3	170754	170764	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176539
80	NC_007579	TCCA	3	172121	172131	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176539
81	NC_007579	CTTT	3	172473	172483	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	81176539
82	NC_007579	CTTT	3	173810	173822	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	81176539
83	NC_007579	GGAA	3	174824	174835	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	81176539
84	NC_007579	ACTT	3	176034	176044	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
85	NC_007579	AAGC	3	178146	178156	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
86	NC_007579	AAAC	3	178905	178916	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	81176539
87	NC_007579	ATTC	5	179511	179530	20	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	81176539
88	NC_007579	CTCG	3	183124	183134	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	81176528
89	NC_007579	ATCC	3	183791	183801	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176528
90	NC_007579	TTCC	3	187475	187485	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	81176528
91	NC_007579	AGTT	3	187513	187524	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	81176528
92	NC_007579	AAGT	3	190680	190690	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	81176528
93	NC_007579	ATCA	3	192891	192901	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176528
94	NC_007579	AAAG	3	193608	193618	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	81176528
95	NC_007579	ACCC	3	196593	196603	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	81176528
96	NC_007579	GCTC	3	197187	197199	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176528
97	NC_007579	TGAA	3	201861	201871	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	81176528
98	NC_007579	CCAG	3	202097	202109	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	81176528
99	NC_007579	TTTC	3	202724	202734	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	81176528
100	NC_007579	TGGA	4	206429	206444	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	81176528
101	NC_007579	TCTA	3	206445	206456	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	81176528
102	NC_007579	CCTT	3	208119	208129	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	81176528
103	NC_007579	TCTA	3	208725	208736	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	81176528
104	NC_007579	CGAG	3	211286	211296	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	81176539
105	NC_007579	AGGC	3	214813	214823	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	81176539
106	NC_007579	ATTT	3	215311	215322	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	81176539
107	NC_007579	AACC	3	215487	215497	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	81176539
108	NC_007579	TTTA	3	218944	218954	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	81176539
109	NC_007579	CTGG	3	222651	222663	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	81176539
110	NC_007579	GAGC	3	223122	223133	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	81176539
111	NC_007579	CAAG	3	226279	226289	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
112	NC_007579	AATG	3	229974	229985	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	81176539
113	NC_007579	GGAA	3	230350	230362	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	81176539
114	NC_007579	TCTA	3	231067	231078	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	81176539
115	NC_007579	AATC	3	236860	236871	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	81176539
116	NC_007579	AGTT	3	240550	240560	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	81176539
117	NC_007579	GTTT	3	242459	242469	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	81176539
118	NC_007579	AAAT	3	245276	245286	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	81176539
119	NC_007579	TCGT	3	247067	247078	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	81176539
120	NC_007579	AAAG	4	247758	247772	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	81176539
121	NC_007579	TTGC	3	248546	248556	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	81176539
122	NC_007579	TAGC	3	250899	250910	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	81176539
123	NC_007579	TCAT	3	254522	254533	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	81176539
124	NC_007579	ACTC	3	255286	255297	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	81176539
125	NC_007579	GAAA	3	256792	256804	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	81176539
126	NC_007579	TTCT	4	257127	257141	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	81176539
127	NC_007579	CATT	6	259325	259349	25	25 %	50 %	0 %	25 %	4 %	81176539
128	NC_007579	GAAC	3	262455	262466	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	81176539
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130	NC_007579	TCCA	3	264018	264028	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176539
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion