ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007579	TAA	4	1068	1078	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007579	GAT	4	1379	1390	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_007579	CTT	4	11328	11339	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007579	GAA	4	11646	11658	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007579	TCA	4	16954	16965	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
6	NC_007579	CAT	4	18009	18020	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
7	NC_007579	TTC	4	23183	23194	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
8	NC_007579	AGA	4	24183	24193	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
9	NC_007579	CTA	4	31130	31142	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
10	NC_007579	CAA	5	33510	33524	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	81176539
11	NC_007579	CAG	4	37290	37301	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
12	NC_007579	AAG	7	40176	40196	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
13	NC_007579	ATA	4	40837	40848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176539
14	NC_007579	ATC	4	43021	43031	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
15	NC_007579	AGA	4	46961	46972	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
16	NC_007579	AGA	4	48238	48250	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
17	NC_007579	ACC	4	50507	50519	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	81176539
18	NC_007579	AAG	4	52416	52427	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
19	NC_007579	CTG	4	53428	53439	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
20	NC_007579	CGT	4	57307	57318	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
21	NC_007579	GTT	4	57664	57674	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
22	NC_007579	AGA	4	63708	63719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
23	NC_007579	AGA	4	69959	69969	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
24	NC_007579	TAC	4	71414	71424	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
25	NC_007579	CAG	4	72510	72520	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
26	NC_007579	GCT	5	76550	76564	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81176539
27	NC_007579	CTT	4	77389	77400	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
28	NC_007579	ATA	4	92176	92188	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81176539
29	NC_007579	TCT	4	95225	95236	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
30	NC_007579	CTT	4	95516	95527	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
31	NC_007579	TAT	4	96779	96791	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81176539
32	NC_007579	TAG	4	99128	99138	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
33	NC_007579	ATA	5	99222	99236	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	81176539
34	NC_007579	CTT	4	99531	99542	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
35	NC_007579	GAC	4	100929	100940	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
36	NC_007579	ATT	4	102597	102607	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81176539
37	NC_007579	CTT	5	105083	105096	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
38	NC_007579	ACT	4	107846	107857	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
39	NC_007579	CTT	4	110120	110131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
40	NC_007579	GAT	4	110746	110758	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
41	NC_007579	CGA	4	111042	111052	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
42	NC_007579	GCT	6	114136	114152	17	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	5 %	81176539
43	NC_007579	AGT	4	114615	114625	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
44	NC_007579	AGT	4	114704	114715	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
45	NC_007579	AAT	4	118968	118979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176539
46	NC_007579	CTT	4	120439	120450	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
47	NC_007579	TTC	4	120521	120531	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
48	NC_007579	CTG	4	122696	122707	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
49	NC_007579	ACT	4	123581	123592	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
50	NC_007579	ATC	4	124593	124603	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
51	NC_007579	GCT	4	126667	126678	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
52	NC_007579	GCA	4	126798	126809	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
53	NC_007579	TCA	4	127750	127760	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
54	NC_007579	TCA	4	130883	130893	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
55	NC_007579	CCA	4	131607	131618	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	81176539
56	NC_007579	TCT	4	132600	132611	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
57	NC_007579	TCT	4	133001	133011	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
58	NC_007579	CTT	4	134153	134163	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
59	NC_007579	TGT	4	134323	134335	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
60	NC_007579	GCC	4	136484	136494	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	81176539
61	NC_007579	CAG	4	137765	137776	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
62	NC_007579	TTG	4	138196	138207	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
63	NC_007579	TTG	4	139926	139936	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
64	NC_007579	GAT	4	143492	143502	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
65	NC_007579	TTC	4	145052	145063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
66	NC_007579	TAT	4	146069	146080	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	81176539
67	NC_007579	TCA	4	148262	148273	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
68	NC_007579	GAT	4	150517	150528	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
69	NC_007579	CTT	4	151852	151862	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
70	NC_007579	CTT	4	153429	153440	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
71	NC_007579	ATA	4	153535	153547	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81176539
72	NC_007579	TAT	7	153544	153564	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81176539
73	NC_007579	AGA	4	153953	153963	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
74	NC_007579	TCT	4	154717	154727	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
75	NC_007579	AAT	4	160224	160235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176539
76	NC_007579	CTT	4	164810	164820	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
77	NC_007579	TCA	4	165526	165536	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
78	NC_007579	GAA	4	166253	166264	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
79	NC_007579	AGA	4	169020	169030	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
80	NC_007579	AGT	4	172271	172281	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
81	NC_007579	TTG	4	174761	174772	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
82	NC_007579	TCT	4	176961	176973	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
83	NC_007579	AAG	4	178579	178589	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
84	NC_007579	AGC	4	178948	178958	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
85	NC_007579	TGC	4	182206	182217	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176528
86	NC_007579	CTT	4	182534	182545	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176528
87	NC_007579	GCT	4	182605	182615	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176528
88	NC_007579	CAA	4	183946	183958	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	81176528
89	NC_007579	TCT	4	184683	184694	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176528
90	NC_007579	GAT	4	185248	185258	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176528
91	NC_007579	CGA	4	187292	187302	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176528
92	NC_007579	CTT	4	191919	191929	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176528
93	NC_007579	AAG	4	193575	193586	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176528
94	NC_007579	CCT	4	193770	193781	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	81176528
95	NC_007579	GAG	4	197532	197542	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	81176528
96	NC_007579	TCT	5	197940	197954	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	81176528
97	NC_007579	CTC	4	200998	201009	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81176528
98	NC_007579	AGC	4	201580	201590	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176528
99	NC_007579	GAT	4	201730	201742	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	81176528
100	NC_007579	CTG	4	201830	201841	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176528
101	NC_007579	GTA	4	206253	206263	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176528
102	NC_007579	AGA	4	207516	207527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176528
103	NC_007579	TTC	4	211638	211649	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
104	NC_007579	GAA	4	212864	212874	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
105	NC_007579	AGA	4	215460	215472	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
106	NC_007579	TCT	4	215796	215807	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
107	NC_007579	GAA	4	215817	215827	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
108	NC_007579	CCA	4	216604	216614	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	81176539
109	NC_007579	AAG	4	216679	216690	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
110	NC_007579	TTC	4	218048	218060	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
111	NC_007579	GAC	4	219649	219659	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
112	NC_007579	GTG	5	220620	220634	15	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	81176539
113	NC_007579	AGG	4	224364	224375	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	81176539
114	NC_007579	ATA	4	229004	229015	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176539
115	NC_007579	TCT	4	229053	229065	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
116	NC_007579	AGC	4	229962	229972	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
117	NC_007579	ATT	4	233768	233779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	81176539
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion