ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lactuca sativa chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007578	TCT	4	808	818	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176230
2	NC_007578	TAC	4	1960	1972	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007578	TTC	4	2194	2205	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176231
4	NC_007578	GAA	4	2999	3010	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176231
5	NC_007578	GAA	4	4857	4868	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007578	TAA	4	7354	7365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007578	ATT	5	9844	9858	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_007578	CAG	4	12397	12407	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
9	NC_007578	GGA	4	17626	17637	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	81176238
10	NC_007578	GAA	4	17673	17683	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176238
11	NC_007578	GTT	5	25046	25060	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	81176241
12	NC_007578	TGT	4	28494	28505	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	81176244
13	NC_007578	TAA	4	31284	31295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007578	TAA	4	32248	32259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_007578	GAG	4	34037	34047	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	81176246
16	NC_007578	TTC	4	34767	34778	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81176246
17	NC_007578	CTT	4	35857	35868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_007578	ATG	4	38345	38355	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176249
19	NC_007578	GCA	4	40243	40254	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176250
20	NC_007578	AGA	4	44799	44810	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_007578	CTT	4	46036	46047	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_007578	ATA	4	48027	48039	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_007578	TTA	4	51340	51351	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_007578	TTC	4	51799	51809	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_007578	TTG	4	55018	55028	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_007578	ATT	4	56820	56832	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_007578	TAA	5	59121	59136	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_007578	TAA	4	59215	59227	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_007578	ATT	4	60881	60893	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_007578	ATA	4	66749	66760	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_007578	TCT	4	73753	73764	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176275
32	NC_007578	CTG	4	78771	78783	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	81176275
33	NC_007578	ATA	4	78840	78851	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176275
34	NC_007578	TAA	4	82361	82373	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81176275
35	NC_007578	TAT	4	83855	83867	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81176275
36	NC_007578	GAT	4	86113	86123	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176275
37	NC_007578	TTC	4	98400	98411	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176274
38	NC_007578	TAT	4	98964	98976	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81176274
39	NC_007578	GAA	5	108815	108829	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	81176274
40	NC_007578	GAA	4	111282	111293	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176274
41	NC_007578	TTA	4	112121	112132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81176274
42	NC_007578	TTC	5	119312	119326	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	81176274
43	NC_007578	ATT	4	119586	119597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	81176274
44	NC_007578	TCT	4	122587	122598	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176274
45	NC_007578	TCT	4	125339	125349	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	81176274
46	NC_007578	TTC	6	128036	128054	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	81176274
47	NC_007578	GAA	4	138458	138469	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176274

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lactuca sativa chloroplast