ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana sylvestris chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007500	TAT	4	173	183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007500	AAG	5	3017	3031	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	78102511
3	NC_007500	ATA	4	6432	6444	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_007500	AAT	4	6447	6459	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007500	ATT	4	24285	24297	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	78102522
6	NC_007500	CAG	4	28939	28950	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007500	TAG	4	32502	32513	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007500	ATT	4	33045	33055	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_007500	TTC	4	36783	36794	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78102528
10	NC_007500	TAA	4	43945	43956	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007500	TAG	4	45885	45895	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	78102534
12	NC_007500	GTA	4	46482	46492	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_007500	ATA	4	47359	47370	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007500	TTA	5	53181	53196	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_007500	TTA	4	53809	53820	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007500	ATA	4	56779	56792	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	78102542
17	NC_007500	TTG	4	57552	57562	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_007500	ATT	4	61348	61358	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_007500	TCT	4	61575	61585	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_007500	ATT	4	65509	65520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_007500	GTT	4	67484	67494	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	78102555
22	NC_007500	TCT	4	67756	67767	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007500	TCT	4	76335	76346	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	78102589
24	NC_007500	AGA	4	79379	79389	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	78102589
25	NC_007500	TTA	4	86393	86404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	78102589
26	NC_007500	CTT	4	86793	86804	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	78102589
27	NC_007500	GAT	4	87260	87270	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	78102589
28	NC_007500	GAT	4	88634	88644	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	78102589
29	NC_007500	TGA	4	93409	93420	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	78102589
30	NC_007500	TTC	4	101234	101245	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	78102562
31	NC_007500	TAA	4	113219	113230	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	78102562
32	NC_007500	AAG	4	113444	113455	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	78102562
33	NC_007500	ATA	4	115396	115406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	78102562
34	NC_007500	TAT	4	120942	120953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	78102562
35	NC_007500	TTC	5	122069	122083	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	78102562
36	NC_007500	TTA	4	130537	130548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	78102562
37	NC_007500	TAT	5	130589	130603	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	78102562
38	NC_007500	GAA	4	141381	141392	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	78102562
39	NC_007500	ATC	4	153982	153992	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_007500	ATC	4	155356	155366	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	78102619
41	NC_007500	GAA	5	155821	155835	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	78102619

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana sylvestris chloroplast