Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phalaenopsis aphrodite subsp. formosana chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007499TTC418341845120 %66.67 %0 %33.33 %8 %126165912
2NC_007499ATA4345034611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_007499TAT4352335331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_007499ATA4381238231266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_007499TAT4885688661133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_007499TAA410878108901366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_007499TTA414113141241233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_007499ATT415944159551233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_007499CTT61616716185190 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
10NC_007499TGC41665216663120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %78103242
11NC_007499GTT42424624257120 %66.67 %33.33 %0 %8 %200004017
12NC_007499GAA428678286881166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_007499TCT42972229733120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_007499AGA429776297861166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
15NC_007499TTG43629336303110 %66.67 %33.33 %0 %9 %78103249
16NC_007499ACC439251392621233.33 %0 %0 %66.67 %8 %78103252
17NC_007499ATG440118401281133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %78103252
18NC_007499TAA545058450711466.67 %33.33 %0 %0 %7 %78103254
19NC_007499TTG44536745377110 %66.67 %33.33 %0 %9 %78103254
20NC_007499AGT447101471121233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %78103255
21NC_007499TCT45041150422120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_007499CTA451940519511233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %78103306
23NC_007499ATT453260532721333.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103256
24NC_007499TTG45590555915110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_007499TAA458596586071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %78103259
26NC_007499TAT458615586261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %78103259
27NC_007499GTT46085060860110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
28NC_007499TTA463282632921133.33 %66.67 %0 %0 %9 %78103263
29NC_007499TAT464205642161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %78103308
30NC_007499TAT464888648991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_007499CAA467884678941166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
32NC_007499TGA670963709811933.33 %33.33 %33.33 %0 %10 %78103327
33NC_007499TTC47121071221120 %66.67 %0 %33.33 %8 %78103327
34NC_007499TAT471871718831333.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103327
35NC_007499TGA476163761751333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %78103327
36NC_007499TTA584259842721433.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103327
37NC_007499ATT484904849151233.33 %66.67 %0 %0 %8 %78103327
38NC_007499CTT48680886819120 %66.67 %0 %33.33 %8 %78103327
39NC_007499GAT488647886571133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %78103327
40NC_007499GAT491666916771233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %78103327
41NC_007499TGA493396934071233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %78103327
42NC_007499CTT49820598215110 %66.67 %0 %33.33 %9 %78103327
43NC_007499TAC41008971009081233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %78103327
44NC_007499AAG41013051013161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %78103326
45NC_007499TAT51019601019731433.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103326
46NC_007499TTA41121271121391333.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103326
47NC_007499TTA41121411121531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %78103326
48NC_007499TAT41126751126851133.33 %66.67 %0 %0 %9 %78103326
49NC_007499ATA41162431162541266.67 %33.33 %0 %0 %8 %78103326
50NC_007499CTT4119812119823120 %66.67 %0 %33.33 %8 %78103326
51NC_007499TCT5121368121382150 %66.67 %0 %33.33 %6 %78103326
52NC_007499TCA41217671217771133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %78103326
53NC_007499ATA41329511329641466.67 %33.33 %0 %0 %7 %78103326
54NC_007499GTA41340141340251233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %78103326
55NC_007499ATC41432451432561233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %78103300
56NC_007499ATC41462651462751133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding