ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus niger mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007445	ATA	5	1155	1169	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	77019996
2	NC_007445	ATT	4	1807	1819	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77019997
3	NC_007445	TAT	7	2241	2261	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77019997
4	NC_007445	TCT	4	2457	2468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77019997
5	NC_007445	ATT	4	2956	2967	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020006
6	NC_007445	TAA	4	3456	3467	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020006
7	NC_007445	TAT	5	3519	3532	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77020006
8	NC_007445	TTA	4	3774	3784	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020007
9	NC_007445	GAA	4	4516	4527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	77020007
10	NC_007445	ATA	4	4615	4626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007445	TAA	5	4793	4807	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_007445	TAT	4	5401	5412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
13	NC_007445	TAT	5	5791	5804	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77019998
14	NC_007445	TTA	4	5832	5843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
15	NC_007445	ATT	4	6011	6022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
16	NC_007445	AAT	4	6997	7007	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_007445	ATA	4	7692	7703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020004
18	NC_007445	TTC	4	8159	8170	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77020004
19	NC_007445	ATA	5	10372	10386	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_007445	CTC	4	10561	10571	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
21	NC_007445	GAT	4	10808	10818	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	77019999
22	NC_007445	TTC	4	11611	11622	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77020008
23	NC_007445	ATC	4	12023	12034	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	77020008
24	NC_007445	TTG	4	12068	12079	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	77020008
25	NC_007445	TTA	4	12117	12129	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77020008
26	NC_007445	TAT	4	12168	12178	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_007445	TAA	4	14724	14736	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_007445	ATT	4	15042	15053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_007445	ATT	4	16291	16302	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_007445	TAA	4	16306	16317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_007445	TAA	4	16807	16817	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_007445	AAG	4	17173	17184	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_007445	ATA	9	17617	17643	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_007445	TAT	5	18936	18949	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_007445	TAT	7	20464	20484	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020010
36	NC_007445	TTA	4	23640	23650	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020005
37	NC_007445	TAT	4	23816	23827	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_007445	TAT	5	24027	24041	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	77020000
39	NC_007445	ATA	4	24636	24646	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	77020009
40	NC_007445	TAT	4	24661	24671	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020009
41	NC_007445	TAA	4	24693	24704	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020009
42	NC_007445	ATT	4	24829	24839	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020009
43	NC_007445	ATG	4	24927	24938	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	77020009
44	NC_007445	TAT	4	25347	25358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_007445	ATT	4	27469	27480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020001
46	NC_007445	TAT	4	28686	28696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
47	NC_007445	ATC	4	29119	29130	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	77020002
48	NC_007445	TTA	4	29175	29185	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
49	NC_007445	TTA	4	29525	29536	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020002
50	NC_007445	TTA	4	29709	29719	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
51	NC_007445	TAA	4	30444	30455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aspergillus niger mitochondrion