ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspergillus niger mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007445	AGTTAT	3	354	371	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	77019996
2	NC_007445	ATA	5	1155	1169	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	77019996
3	NC_007445	TA	6	1286	1297	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007445	GC	6	1483	1494	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007445	A	12	1767	1778	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	77019997
6	NC_007445	ATT	4	1807	1819	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77019997
7	NC_007445	TAT	7	2241	2261	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77019997
8	NC_007445	TCT	4	2457	2468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77019997
9	NC_007445	ATT	4	2956	2967	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020006
10	NC_007445	ATTT	3	3033	3043	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	77020006
11	NC_007445	TAA	4	3456	3467	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020006
12	NC_007445	TAT	5	3519	3532	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77020006
13	NC_007445	TTA	4	3774	3784	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020007
14	NC_007445	GAA	4	4516	4527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	77020007
15	NC_007445	ATA	4	4615	4626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_007445	CAAT	4	4736	4750	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
17	NC_007445	TAA	5	4793	4807	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_007445	ATCC	3	4891	4903	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
19	NC_007445	TA	6	5181	5191	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_007445	TA	7	5377	5390	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_007445	TAT	4	5401	5412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
22	NC_007445	TAT	5	5791	5804	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77019998
23	NC_007445	TTA	4	5832	5843	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
24	NC_007445	ATT	4	6011	6022	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77019998
25	NC_007445	A	15	6859	6873	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	77019998
26	NC_007445	TATAAT	3	6874	6891	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_007445	AAT	4	6997	7007	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_007445	ATA	4	7692	7703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020004
29	NC_007445	TTC	4	8159	8170	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77020004
30	NC_007445	A	17	8570	8586	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_007445	T	13	8829	8841	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007445	GATAAT	3	9340	9357	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_007445	TTAT	3	9923	9934	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_007445	TA	8	10237	10251	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_007445	ATA	5	10372	10386	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_007445	CTC	4	10561	10571	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
37	NC_007445	GAT	4	10808	10818	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	77019999
38	NC_007445	TTC	4	11611	11622	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	77020008
39	NC_007445	ATC	4	12023	12034	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	77020008
40	NC_007445	TTG	4	12068	12079	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	77020008
41	NC_007445	TTA	4	12117	12129	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	77020008
42	NC_007445	TAT	4	12168	12178	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_007445	TA	6	12276	12287	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_007445	A	15	12442	12456	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_007445	T	13	12611	12623	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_007445	A	13	12633	12645	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_007445	ATAATT	4	12979	13001	23	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
48	NC_007445	ATTAAT	3	14465	14483	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_007445	TATT	3	14683	14694	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_007445	TAA	4	14724	14736	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_007445	TAATA	3	14760	14775	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_007445	T	12	14789	14800	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_007445	AGTA	3	14950	14961	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_007445	ATT	4	15042	15053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_007445	TTATAT	3	15641	15658	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_007445	ATT	4	16291	16302	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_007445	TAA	4	16306	16317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_007445	TA	6	16383	16396	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_007445	TAA	4	16807	16817	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_007445	AAG	4	17173	17184	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_007445	ATA	9	17617	17643	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_007445	TA	13	18001	18024	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_007445	T	12	18922	18933	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007445	TAT	5	18936	18949	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_007445	TA	7	19533	19545	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_007445	T	18	19739	19756	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_007445	TAT	7	20464	20484	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020010
68	NC_007445	A	13	21289	21301	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	77020010
69	NC_007445	AG	6	21459	21469	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	77020010
70	NC_007445	G	12	21583	21594	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	77020010
71	NC_007445	TTA	4	23640	23650	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020005
72	NC_007445	A	15	23749	23763	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_007445	TAAT	6	23773	23795	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_007445	T	18	23794	23811	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_007445	TAT	4	23816	23827	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_007445	TAT	5	24027	24041	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	77020000
77	NC_007445	TTATAA	3	24199	24216	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	77020000
78	NC_007445	T	16	24333	24348	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007445	ATA	4	24636	24646	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	77020009
80	NC_007445	TAT	4	24661	24671	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020009
81	NC_007445	TAA	4	24693	24704	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	77020009
82	NC_007445	ATT	4	24829	24839	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020009
83	NC_007445	ATG	4	24927	24938	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	77020009
84	NC_007445	TAT	4	25347	25358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_007445	AT	8	25481	25496	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_007445	AT	6	25684	25697	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_007445	ATTT	3	25725	25736	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	77020011
88	NC_007445	TA	6	25882	25892	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	77020011
89	NC_007445	TTTA	3	26798	26809	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	77020001
90	NC_007445	TATT	3	27097	27108	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	77020001
91	NC_007445	ATT	4	27469	27480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020001
92	NC_007445	TAAA	3	28434	28445	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_007445	A	14	28509	28522	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_007445	T	15	28549	28563	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007445	TAT	4	28686	28696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
96	NC_007445	ATTAT	3	29083	29096	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	77020002
97	NC_007445	ATC	4	29119	29130	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	77020002
98	NC_007445	TTA	4	29175	29185	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
99	NC_007445	TTA	4	29525	29536	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	77020002
100	NC_007445	TTA	4	29709	29719	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	77020002
101	NC_007445	TTAA	3	30060	30071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	77020002
102	NC_007445	TA	9	30319	30336	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_007445	TAA	4	30444	30455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_007445	A	13	30451	30463	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_007445	TATAA	3	30623	30636	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspergillus niger mitochondrion