ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Acorus calamus plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007407	CAG	4	1057	1068	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	75755639
2	NC_007407	ATT	5	13923	13937	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_007407	TTA	4	15765	15777	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	75755648
4	NC_007407	GTT	4	23774	23785	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	75755650
5	NC_007407	TGA	4	27673	27684	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_007407	ATA	4	28040	28051	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007407	AAT	4	33109	33120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_007407	GGA	4	34982	34993	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	75755655
9	NC_007407	TCT	5	37613	37627	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	75755657
10	NC_007407	ATG	4	39167	39177	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	75755658
11	NC_007407	GCA	4	41065	41076	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	75755659
12	NC_007407	ATA	5	45678	45692	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_007407	ATT	4	46068	46079	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007407	AGT	4	46435	46446	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	75755661
15	NC_007407	TAA	4	47263	47273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_007407	TGA	4	53722	53732	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_007407	ATA	4	56549	56559	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_007407	TTA	4	65471	65482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007407	TAT	4	70559	70571	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	75755683
20	NC_007407	TCT	4	70601	70612	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	75755683
21	NC_007407	GAA	4	83994	84004	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	75755683
22	NC_007407	CTT	4	84230	84241	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	75755683
23	NC_007407	GAT	4	86074	86084	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	75755683
24	NC_007407	GAT	5	92120	92134	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	75755683
25	NC_007407	TCA	5	92300	92313	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	75755683
26	NC_007407	ACG	4	93586	93596	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	75755683
27	NC_007407	GAA	4	109368	109379	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	75755682
28	NC_007407	GAA	7	109728	109748	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	75755682
29	NC_007407	AAG	4	111401	111412	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	75755682
30	NC_007407	TAT	4	114120	114130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	75755682
31	NC_007407	TAA	4	123306	123317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	75755682
32	NC_007407	ATA	4	126713	126723	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	75755682
33	NC_007407	GTA	4	127186	127197	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	75755682
34	NC_007407	TGT	5	127321	127335	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	75755682
35	NC_007407	TCA	4	127825	127835	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	75755682
36	NC_007407	TCT	8	128222	128244	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	75755682
37	NC_007407	TCT	4	128593	128604	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	75755682
38	NC_007407	TGA	5	145658	145671	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	126022805
39	NC_007407	ATC	5	145837	145851	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	126022805
40	NC_007407	ATC	4	151887	151897	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Acorus calamus plastid