ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Thalassiosira pseudonana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007405	TAA	4	916	928	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	74325167
2	NC_007405	GTA	4	986	996	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	74325167
3	NC_007405	CTTT	3	1604	1615	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	74325167
4	NC_007405	ATA	4	3377	3388	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	74325167
5	NC_007405	ATA	5	3632	3646	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	74325167
6	NC_007405	GAT	4	3812	3823	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	74325167
7	NC_007405	CCCT	3	6267	6277	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
8	NC_007405	AAAT	3	6328	6339	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007405	TATT	3	9856	9867	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007405	GGGA	3	9904	9914	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_007405	GTAC	3	9978	9988	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_007405	ATT	5	10661	10674	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	74325169
13	NC_007405	TTAA	3	10782	10793	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	74325169
14	NC_007405	T	13	10804	10816	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	74325169
15	NC_007405	TA	6	11140	11150	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	74325169
16	NC_007405	AAAAT	4	12138	12156	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_007405	TTTTA	3	12955	12969	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_007405	AAAT	3	14318	14328	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_007405	GTTTTA	3	16203	16220	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	74325170
20	NC_007405	ATT	4	16596	16606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	74325170
21	NC_007405	TTTA	3	16706	16717	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	74325170
22	NC_007405	T	12	17698	17709	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007405	CTTT	3	18211	18222	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	74325172
24	NC_007405	TTG	4	18541	18552	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	74325172
25	NC_007405	TAT	4	19235	19247	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	74325173
26	NC_007405	TTTG	3	19294	19304	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	74325173
27	NC_007405	GTAT	3	20307	20318	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	74325173
28	NC_007405	ATTT	3	20505	20516	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	74325173
29	NC_007405	AATT	3	20774	20785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	74325174
30	NC_007405	ATTT	3	20897	20908	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	74325174
31	NC_007405	T	12	21259	21270	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	74325174
32	NC_007405	TGT	4	21294	21305	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	74325174
33	NC_007405	ATTT	3	22114	22124	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	74325174
34	NC_007405	TTTC	3	22873	22883	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	74325176
35	NC_007405	TTAA	3	24467	24479	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	74325179
36	NC_007405	AAT	4	27090	27101	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	74325180
37	NC_007405	ATAA	5	27179	27198	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	74325180
38	NC_007405	TTTG	3	27426	27436	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	74325181
39	NC_007405	AAAAG	3	27855	27869	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	74325182
40	NC_007405	TAA	4	27998	28009	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	74325182
41	NC_007405	A	15	28470	28484	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	74325183
42	NC_007405	A	12	28592	28603	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	74325183
43	NC_007405	CAA	4	28729	28741	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	74325184
44	NC_007405	A	13	28930	28942	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	74325184
45	NC_007405	GAAAA	3	29052	29065	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	74325184
46	NC_007405	TTTA	3	29842	29854	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_007405	TAAA	3	31040	31051	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	74325187
48	NC_007405	T	16	31993	32008	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_007405	TAT	4	32161	32171	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_007405	A	12	32372	32383	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007405	GTTT	3	32651	32661	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	74325188
52	NC_007405	GATT	3	32681	32691	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	74325188
53	NC_007405	TTTTG	3	32798	32811	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	74325188
54	NC_007405	CAAA	3	33285	33296	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	74325189
55	NC_007405	A	18	34233	34250	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	74325190
56	NC_007405	TA	6	34353	34364	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	74325191
57	NC_007405	A	13	34569	34581	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	74325191
58	NC_007405	AT	6	35600	35610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	74325192
59	NC_007405	AGCAGG	3	35813	35830	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	74325193
60	NC_007405	ATATA	3	36540	36553	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	74325195
61	NC_007405	ATT	4	36838	36849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	74325195
62	NC_007405	GTG	4	39009	39020	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_007405	TTA	4	39056	39067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_007405	AAAT	3	40074	40085	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	74325196
65	NC_007405	TTTCA	4	40615	40634	20	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	74325198
66	NC_007405	ATT	4	42508	42518	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	74325199
67	NC_007405	CTA	4	42640	42650	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	74325200
68	NC_007405	TAA	4	42686	42697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	74325200
69	NC_007405	AAAC	3	42987	42998	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	74325200
70	NC_007405	CAAT	3	43203	43213	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	74325200

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Thalassiosira pseudonana mitochondrion