ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Emiliania huxleyi chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007288	GCA	4	7588	7598	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	71842223
2	NC_007288	TGT	4	11893	11904	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	71842225
3	NC_007288	AAG	4	14367	14377	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	71842227
4	NC_007288	TTA	4	20907	20917	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_007288	ACA	4	22860	22871	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	71842235
6	NC_007288	ACA	4	26345	26355	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	71842239
7	NC_007288	TAA	4	29570	29582	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	71842244
8	NC_007288	TGA	4	31712	31722	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	71842246
9	NC_007288	AAT	4	32400	32411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71842246
10	NC_007288	GCT	4	34579	34590	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	71842249
11	NC_007288	GGT	4	35470	35481	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	71842249
12	NC_007288	CAA	4	37702	37713	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	71842251
13	NC_007288	AAT	4	38750	38761	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007288	TAA	4	45226	45237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71842262
15	NC_007288	ATA	4	45756	45766	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_007288	ATA	4	46852	46863	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71842265
17	NC_007288	AAT	4	49777	49787	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71842271
18	NC_007288	TAA	4	56245	56256	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	71842274
19	NC_007288	AGA	4	56381	56392	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	71842274
20	NC_007288	AGA	4	57303	57313	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	71842274
21	NC_007288	AGA	4	60007	60018	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	71842276
22	NC_007288	ATA	4	60514	60525	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007288	TCT	4	61493	61505	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	71842278
24	NC_007288	AGA	4	65257	65268	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007288	CTG	4	65756	65767	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	71842283
26	NC_007288	ATT	4	69951	69962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	71842289
27	NC_007288	TGA	4	70863	70874	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	71842290
28	NC_007288	TTG	4	72825	72836	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	71842291
29	NC_007288	TTC	4	72975	72986	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	71842291
30	NC_007288	AAC	4	74659	74670	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	71842293
31	NC_007288	TGC	5	75551	75565	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	71842294
32	NC_007288	ATA	4	76706	76716	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_007288	TAA	5	79040	79053	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_007288	TTC	4	82043	82053	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
35	NC_007288	TAA	4	89597	89607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	71842313
36	NC_007288	TAT	4	90797	90809	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	71842314
37	NC_007288	GTT	4	97038	97049	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71842327
38	NC_007288	ATT	4	97935	97946	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	71842328
39	NC_007288	ATT	4	98070	98080	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71842328
40	NC_007288	TGG	4	99546	99557	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	71842331
41	NC_007288	ACA	4	101560	101571	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	71842335
42	NC_007288	ATT	4	102033	102043	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	71842336
43	NC_007288	GAA	4	102265	102275	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	71842336
44	NC_007288	ACA	4	103184	103194	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	71842337

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Emiliania huxleyi chloroplast